台江國家公園位於北廻歸線以南，兼受季風影響屬於亞熱帶氣候。根據中央氣象署民國104年統計資料顯示，6月至9月氣溫最高，達28.75℃以上；同年12月至翌年1月最低，在20℃以下。最冷月 1 月平均溫度為17.1℃；最熱月6月平均為32.8℃，溫差15℃以上；年平均氣溫24.5℃；近 30年統計資料顯示，月均溫上升0.3℃，最高溫差為1.3℃，最低溫為-3.9℃。整體而言，氣溫之變化差距劇增。
台江國家公園因受季風及地形影 響，降雨、乾、濕季分明，雨量集中在5月到9月之梅雨季及颱風季，約佔全年的90%。而乾旱開始時期與東北季風季節大致相同，約從10月起至隔年的4月為乾季，雨量稀少；近30年統計資料顯示，年雨量方面略增20mm。
104年七股地區全年日照充足，年總數2,862小時，相較臺南地區 30年平均日照總時數為多。
台江國家公園冬季受大陸冷氣團 影響，盛吹東北至偏北季風，天氣乾燥冷冽，夏季則受太平洋高壓影響，西南氣流旺盛，盛吹南風及西南季風，高溫多濕。
由過去氣象紀錄顯示，颱風侵臺時間集中在5~9月；因位於嘉南平原西側，受中央山脈屏障，颱風影響較小。
七股地區相對濕度年平均76%，各月相對濕度約在72~80%之間，相較臺南地區30年平均濕度為低。
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