Användare:Jannieboiah/sandlåda

Terminator (genetics)

Inom genetiken är en transkriptionsterminator en del av en genomisk DNA-sekvens som markerar slutet av en gen eller en operon under transkriptionen. Denna sekvens avbryter transkriptionen genom att introducera signaler i det syntetiserade mRNA som startar processer som får mRNA att lossna från transkriptionskomplexet. Dessa processer inkluderar direkt interaktion av mRNA:s sekundärstruktur med komplexet och/eller indirekt aktivitet av rekryterade terminationsfaktorer. När transkriptionskomplexet lossnar frigörs RNA polymeras, samt relaterade transkriptions maskineri, för att kunna starta transkription av nya mRNA.

Terminator i prokaryoter

I prokaryoters genom har två olika sorters transkriptionsterminatorer identifierats: Rho-beroende och Rho-oberoende. Dessa sekvenser är ansvariga för att avsluta transkriptionen då en hel gen eller operon transkriberats, förmedla tidig termination av transkripts som inte behövs (t.ex. via riboswitch) samt avsluta transkriptionen från transkriptionskomplex som på något sätt missat tidigare transkriptionsterminatorer.

Rho-beroende terminatorer

Rho-beroende termination sker nedströms om stoppkodonet för translationen och uppkommer genom en interaktion mellan Rho-faktorn och RNA polymeras. Rho-beroende terminatorer finns i bakterier och bakteriofager.

Rho-faktor är ett ringformat helikas och ATPas bestående av sex identiska subenheter. Rho-faktorn binder till en cytosinrik sekvens på det syntetiserade mRNA:t som kallas rut (engelska Rho utilization). Denna sekvens är cirka 80 nukleotider lång och finns uppströms om tsp (engelska transcription stop point) där transkriptionen avslutas. Rho-faktorn rör sig längs det syntetiserade mRNA:t tills den når RNA polymeraset och dissocierar då polymeraset från RNA och DNA mallen.