Kopējā kravas masa starta brīdī bija 2487 kg. Īpašajās tvertnēs ietilpa degviela (869 kg), saspiestas gāzes (slāpeklis) (43 kg), ūdens (420 kg). Hermētiskajā kravas telpā (pavisam 1 155 kg) bija iekārtas stacijas apkalpošanai un zinātniskajiem pētījumiem, pārtikas preces, apģērbs, higiēnas, medicīnas preces.[1]
Progress MS-29 tika palaists 2024. gada 21. novembrī 12:22:23 UTC ar nesējraķeti Sojuz-2.1a no Baikonuras kosmodroma 31. starta laukuma.
23. novembrī 14:31:16 UTC kosmosa kuģis saslēdzās ar SKS automātiskā režīmā pie Poisk moduļa.
Atvēruši kravas kuģa lūku, kosmonauti sajuta asu toksisku smaku un atklāja neidentificējamus pilienus. Lai novērstu nezināmās vielas izplatīšanos, apkalpe bija spiesta steidzami aizvērt lūku. Kosmonauti, kas strādāja stacijas Krievijas segmentā, uzģērba aizsargtērpus, un tika uzsākta pastiprināta stacijas gaisa attīrīšanas sistēmu darbība. Arī ASV astronauti sajuta neparastu smaku, kas līdzinājās krāsas izsmidzināšanai. NASA ziņoja, ka situācija stacijā pakāpeniski stabilizējās, un gaisa kvalitāte atgriezās normālā līmenī.[2] Lūku atkal atvēra 25. novembrī, un kravas kuģa izkraušana turpinājās kā plānots. NASA paziņoja, ka iespējamais smakas avots ir izdalījušās gāzes no materiāliem hermetizētajā kravas nodalījumā. Savukārt daži Krievijas kosmosa nozares pārstāvji izteica hipotēzi, ka smaka un pilieni varētu būt radušies no kuģa Progress MS-27, kas pirms atvienošanās 19. novembrī no tās pašas pieslēgvietas bija piepildīts ar atkritumiem.
Derīgās kravas atdalītas ar aizzīmēm ( · ), starti ar vertikālā svītrām ( | ). Pilotējamie lidojumi izcelti treknā tekstā. Startu avārijas atzīmētas nosvītrotas; nepareizā orbītā ievadīts vai citas kļūmes, kuru dēļ kosmisko aparātu nevar lietderīgi izmantot, apzīmēts kursīvā. Derīgās kravas, kas palaistas no citiem kosmiskajiem aparātiem, iekļautas (iekavās).