Muggsopp er små sopper som kan lage store mengder sporer. Muggsopp finnes nesten over alt. I naturen lever de på døde planter.
Mennesker bruker noen muggsopper for å lage medisiner og matvarer. Muggsopp som vokser inne i hus kan gjøre skade og gi allergi. Noen muggsopper produserer giftige stoffer, for eksempel visse arter strålemugg.
Medisinen penicillin lages av en muggsopp som dreper bakterier. Den brukes ofte for å behandle infeksjon i luftveiene.
Blåmuggost og hvitmuggost er ost med bestemte muggsopper som gir osten en spesiell smak.
Når man lager laktosefrie melkeprodukter brukes enzymer fra en muggsopp for å bryte ned laktosen.