Jmol
Jmol è un visualizzatore open source che permette di ottenere la struttura molecolare in 3D.[1] Jmol fornisce una rappresentazione in 3D di una molecola che può essere utilizzata come strumento di insegnamento,[2] o in campi di ricerca quali la chimica e la biochimica. È un software scritto in Java e può essere utilizzato su sistemi Windows, Mac OS X, Linux e Unix. Esistono una applicazione stand-alone e un insieme di strumenti di sviluppo che possono essere integrati in altre applicazioni Java. La caratteristica più rilevante è una applet che può essere integrata in pagine web per mostrare le molecole in una varietà di modi (ball and stick, space filling, ribbon, ecc.).[3] Jmol supporta un'ampia varietà di formati di file molecolari, includendo Protein Data Bank (pdb), Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol), e Chemical Markup Language (CML).
L'applet Jmol, tra le altre caratteristiche, offre una alternativa al plugin Chime,[4] che non è più sotto sviluppo attivo.
Note
- ^ Jim X. Chen, Guide to Graphics Software Tools, Springer, 2008, p.471, ISBN 978-1-84800-900-4.
- ^ A. Herráez, Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue, in Biochemistry and Molecular Biology Education, vol. 34, n. 4, 2006, p. 7, DOI:10.1002/bmb.2006.494034042644.
- ^ Angel Herráez, How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1, Lulu, 2007, p.21, ISBN 978-1-84799-259-8.
- ^ Jim X. Chen, Guide to Graphics Software Tools, Springer, 2008, p.471, ISBN 978-1-84800-900-4.
Voci correlate
Collegamenti esterni
- (EN) Sito ufficiale Jmol
- (EN) Jmol wiki
