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Jmol: differenze tra le versioni

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'''Jmol''' è un visualizzatore [[open source]] che permette di ottenere la struttura molecolare in 3D.<ref> {{cita libro | cognome= Chen| nome= Jim X.| titolo= Guide to Graphics Software Tools |url= http://books.google.it/books?id=Rv2gncprg3gC&pg=PA471&dq=jmol+is+3d&hl=it&ei=y28TTLmALYuXOPSt0LkM&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=1&ved=0CC0Q6AEwAA#v=onepage&q=jmol%20is%203d&f=false|editore=Springer | anno=2008| id=ISBN 978-1-84800-900-4 | pagine=471}}</ref> Jmol fornisce una rappresentazione in 3D di una [[molecola]] che può essere utilizzata come strumento di insegnamento,<ref>{{cita pubblicazione |cognome= Herráez|nome=A. |anno= 2006|titolo= Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue|rivista= Biochemistry and Molecular Biology Education |volume= 34|numero= 4|pagine= 7|doi= 10.1002/bmb.2006.494034042644|url= http://eric.ed.gov/ERICWebPortal/custom/portlets/recordDetails/detailmini.jsp?_nfpb=true&_&ERICExtSearch_SearchValue_0=EJ759053&ERICExtSearch_SearchType_0=no&accno=EJ759053}}</ref> o in campi di ricerca quali la [[chimica]] e la [[biochimica]]. È un [[software]] scritto in [[Java]] e può essere utilizzato su sistemi [[Windows]], [[Mac OS X]], [[Linux]] e [[Unix]]. Esistono una applicazione [[Stand-alone (informatica)|stand-alone]] e un insieme di strumenti di sviluppo che possono essere integrati in altre applicazioni Java. La caratteristica più rilevante è una [[applet]] che può essere integrata in pagine [[web]] per mostrare le molecole in una varietà di modi (ball and stick, space filling, ribbon, ecc.).<ref> {{cita libro | cognome= Herráez| nome= Angel| titolo= How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1 |url= http://books.google.it/books?id=59kQFyfbsJMC&pg=PA21&dq=jmol+applet+web&hl=it&ei=CXQTTJzpFsKSOKLF8MEM&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=1&ved=0CDAQ6AEwAA#v=onepage&q=jmol%20applet%20web&f=false|editore=Lulu | anno=2007| id=ISBN 978-1-84799-259-8 | pagine=21}}</ref> Jmol supporta un'ampia varietà di formati di [[file]] molecolari, includendo [[Protein Data Bank]] (pdb), [[Crystallographic Information File]] (cif), [[MDL Molfile]] (mol), e [[Chemical Markup Language]] (CML).
'''Jmol''' è un visualizzatore [[open source]] che permette di visualizzare le strutture molecolare in 3D:<ref name="books.google.it">{{cita libro | cognome= Chen| nome= Jim X.| titolo= Guide to Graphics Software Tools |url= http://books.google.it/books?id=Rv2gncprg3gC&pg=PA471&dq=jmol+is+3d&hl=it&ei=y28TTLmALYuXOPSt0LkM&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=1&ved=0CC0Q6AEwAA#v=onepage&q=jmol%20is%203d&f=false|editore=Springer | anno=2008| ISBN=978-1-84800-900-4| pagine=p.471}}</ref> mostra una rappresentazione in 3D di una [[molecola]] che può essere utilizzata come strumento di insegnamento,<ref>{{cita pubblicazione |cognome= Herráez|nome=A. |anno= 2006|titolo= Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue|rivista= Biochemistry and Molecular Biology Education |volume= 34|numero= 4|pagine= 7|doi= 10.1002/bmb.2006.494034042644|url= http://eric.ed.gov/ERICWebPortal/custom/portlets/recordDetails/detailmini.jsp?_nfpb=true&_&ERICExtSearch_SearchValue_0=EJ759053&ERICExtSearch_SearchType_0=no&accno=EJ759053}}</ref> o in campi di ricerca quali [[chimica]] e [[biochimica]]. È un [[software]] scritto in [[Java (linguaggio di programmazione)|Java]] e può essere utilizzato su sistemi [[Windows]], [[macOS]], [[Linux]] e [[Unix]]. Esistono una applicazione [[Stand-alone (informatica)|stand-alone]] e un insieme di strumenti di sviluppo che possono essere integrati in altre applicazioni Java. La sua caratteristica più rilevante è un'[[applet]] che può essere integrata in pagine [[web]] per mostrare le molecole in una varietà di modi (ball and stick, space filling, ribbon, ecc.).<ref>{{cita libro | cognome= Herráez| nome= Angel| titolo= How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1 |url= http://books.google.it/books?id=59kQFyfbsJMC&pg=PA21&dq=jmol+applet+web&hl=it&ei=CXQTTJzpFsKSOKLF8MEM&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=1&ved=0CDAQ6AEwAA#v=onepage&q=jmol%20applet%20web&f=false|editore=Lulu | anno=2007| ISBN=978-1-84799-259-8| pagine=p.21}}</ref> Jmol supporta molti formati di [[file]]: [[Protein Data Bank]] (.pdb), [[Crystallographic Information File]] (.cif), [[MDL Molfile]] (.mol), e [[Chemical Markup Language]] (.CML).


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L'applet Jmol, tra le altre caratteristiche, offre una alternativa al [[plugin (informatica)|plugin]] [[MDL Chime|Chime]],<ref name="books.google.it"/> non più sviluppato.


==Note==
==Note==
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* [[Chemistry Development Kit]]
* [[Chemistry Development Kit]]
* [[Proteopedia]]
* [[Proteopedia]]
* [[PyMol]]
* [[PyMOL]]

== Altri progetti ==
{{interprogetto}}


==Collegamenti esterni==
==Collegamenti esterni==
* {{Collegamenti esterni}}
* {{en}} [http://jmol.sourceforge.net/ Sito ufficiale Jmol]
* {{en}} [http://wiki.jmol.org/index.php/Main_Page Jmol wiki]
* {{cita web|http://wiki.jmol.org/index.php/Main_Page|Jmol wiki|lingua=en}}


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[[Categoria:Software per la chimica]]
[[Categoria:Software per la chimica]]
[[Categoria:Bioinformatica]]
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Versione attuale delle 09:22, 16 ago 2023

Jmol
software
Logo
Logo
Schermata di esempio
Schermata di esempio
GenereModellistica molecolare (non in lista)
SviluppatoreJmol development team
Ultima versione14.4.4 (23 aprile 2016; 8 anni fa)
Ultima beta14.5.0 (7 novembre 2015; 9 anni fa)
Sistema operativoWindows, Linux, Mac (non in lista)
LinguaggioJava
LicenzaLGPL
(licenza libera)
LinguaMultilingue
Sito webwww.jmol.org

Jmol è un visualizzatore open source che permette di visualizzare le strutture molecolare in 3D:[1] mostra una rappresentazione in 3D di una molecola che può essere utilizzata come strumento di insegnamento,[2] o in campi di ricerca quali chimica e biochimica. È un software scritto in Java e può essere utilizzato su sistemi Windows, macOS, Linux e Unix. Esistono una applicazione stand-alone e un insieme di strumenti di sviluppo che possono essere integrati in altre applicazioni Java. La sua caratteristica più rilevante è un'applet che può essere integrata in pagine web per mostrare le molecole in una varietà di modi (ball and stick, space filling, ribbon, ecc.).[3] Jmol supporta molti formati di file: Protein Data Bank (.pdb), Crystallographic Information File (.cif), MDL Molfile (.mol), e Chemical Markup Language (.CML).

L'applet Jmol, tra le altre caratteristiche, offre una alternativa al plugin Chime,[1] non più sviluppato.

  1. ^ a b Jim X. Chen, Guide to Graphics Software Tools, Springer, 2008, p.471, ISBN 978-1-84800-900-4.
  2. ^ A. Herráez, Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue, in Biochemistry and Molecular Biology Education, vol. 34, n. 4, 2006, p. 7, DOI:10.1002/bmb.2006.494034042644.
  3. ^ Angel Herráez, How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1, Lulu, 2007, p.21, ISBN 978-1-84799-259-8.

Voci correlate

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Altri progetti

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Collegamenti esterni

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