ﻛﻴﻤﻴﺎء ﺣﻴﻮﻳﺔ ﻋﺎﻣﺔ )(BCH 101
ﺍﻷﲪﺎﺽ ﺍﻟﻨﻮﻭﻳﺔ
Nucleic Acids
ﺍﻷﲪﺎﺽ ﺍﻟﻨﻮﻭﻳﺔ
ﺣﺎﻣﺾ ﻧﻮﻭﻱ ﺩﻳﻮﻛﺴﻲ ﺭﻳﺒﻮﺯﻱ DNA
RNA ﺣﺎﻣﺾ ﻧﻮﻭﻱ ﺭﻳﺒﻮﺯﻱ
ﺗﺮﻛﻴﺐ ﺍﻷﲪﺎﺽ ﺍﻟﻨﻮﻭﻳﺔ
اﻟﻨﻴﻜﻠﻴﻮﺗﻴﺪات
ﺳﻜﺮ ﲬﺎﺳﻲ ﻗﺎﻋﺪﺓ ﻧﻴﱰﻭﺟﻴﻨﻴﺔ
ﳎﻤﻮﻋﺔ ﻓﻮﺳﻔﺎﺕ
ﺍﻟﻘﻮﺍﻋﺪ ﺍﻟﻨﻴﱰﻭﺟﻴﻨﻴﺔ
ﺍﻟﻨﻴﱰﻭﺟﻴﻨﻴﺔ ﺍﻟﻘﻮﺍﻋﺪ
ﰲ DNAﻳﻮﺟﺪ ﺃﺭﺑﻌﺔ ﻗﻮﺍﻋﺪ ﻧﻴﱰﻭﺟﻴﻨﻴﺔ
A ﺃﺩﻧﲔ
G ﺟﻮﺍﻧﲔ
T ﺛﺎﳝﲔ
DNA
C ﺳﻴﺘﻮﺯﻳﻦ
ﺃﻣﺎ ﰲ RNAﻳﺘﻢ ﺍﺳﺘﺒﺪﺍﻝ ﺍﻟﺜﺎﳝﲔ ) (Tﺑﺎﻟﻴﻮﺭﺍﺳﻴﻞ )(U
H
7
1 6
5 N
N
8
2 N 4 N 9
H2N 3
H
NH2 O
5 7 7
1N 6 N 1 6
5 N
N
8 8
2 4 2 4
N N9 H2N N N 9
3
3
H H
א
H
3 C4 5
N CH
HC 2 CH
N1 6
H
NH2 O O
3 3 CH3 3
4
N 4 CH
5
HN 5 HN 4 CH
5
2 2 2
CH CH CH
O N1 6 O N1 6 O N1 6
H H H
א
ﺍﻟﺴﻜﺮ ﺍﳋﻤﺎﺳﻲ
)(RNA ﺭﻳﺒﻮﺯﻱ
)(DNA ﺩﻳﻮﻛﺴﻲ ﺭﻳﺒﻮﺯﻱ
C H2O H OH C H2O H OH
O O
4 4
C H C1 C H C1
H H
H H C H
H C C2 3 C 2
3
OH H OH OH
D-β א א D-β א
β-D Deoxyribose β-D Ribose
اﻟﻨﻴﻮآﻠﻴﻮﺳﻴﺪ واﻟﻨﻴﻮآﻠﻴﻮﺗﻴﺪ
• اﻟﻨﻴﻮآﻠﻴﻮﺳﻴﺪ )ﻗﺎﻋﺪة ﻧﻴﺘﺮوﺟﻴﻨﻴﺔ +ﺳﻜﺮ ﺧﻤﺎﺳﻲ(
• اﻟﻨﻴﻮآﻠﻴﻮﺗﻴﺪ )ﻗﺎﻋﺪة ﻧﻴﺘﺮوﺟﻴﻨﻴﺔ +ﺳﻜﺮ ﺧﻤﺎﺳﻲ +ﻓﻮﺳﻔﺎت(
• اﻟﻨﻴﻮآﻠﻴﻮﺗﻴﺪ )ﻧﻴﻮآﻠﻴﻮﺳﻴﺪ +ﻓﻮﺳﻔﺎت(
ﻳﻜﻮن ارﺗﺒﺎط اﻟﻘﺎﻋﺪة اﻟﻨﻴﺘﺮوﺟﻴﻨﻴﺔ ﺑﺎﻟﺴﻜﺮ ﺑﻮاﺳﻄﺔ راﺑﻄﺔ ﺟﻼﻳﻜﻮزﻳﺪﻳﺔ ﻧﻴﺘﺮوﺟﻴﻨﻴﺔ ﺑﻴﻦ: •
ذرة اﻟﻜﺮﺑﻮن رﻗﻢ ١ﺑﺎﻟﺴﻜﺮ
+
ذرة اﻟﻨﻴﺘﺮوﺟﻴﻦ
رﻗﻢ ٩ﻓﻲ اﻟﺒﻴﻮرﻳﻨﺎت رﻗﻢ ١ﻓﻲ اﻟﺒﺮﻳﻤﻴﺪﻳﻨﺎت
ﺗﺴﻤﻴﺔ اﻟﻨﻴﻮآﻠﻴﻮﺗﻴﺪات اﻷﺣﺎدﻳﺔ
اﻟﻄﺮﻳﻘﺔ اﻷوﻟﻰ :ﻳﺴﻤﻰ ﺣﻤﺾ ﻣﺸﺘﻖ ﻣﻦ اﻟﻘﺎﻋﺪة اﻟﻨﻴﺘﺮوﺟﻴﻨﻴﺔ اﻟﺪاﺧﻠﺔ ﻓﻲ ﺗﺮآﻴﺒﻪ •
ﻣﺜﺎل :ﺣﻤﺾ أدﻳﻨﻴﻠﻚ أو دﻳﻮآﺴﻲ أدﻳﻨﻴﻠﻚ ﻣﻦ اﻷدﻧﻴﻦ •
ﺣﻤﺾ ﺟﻮاﻧﻴﻠﻴﻚ أو دﻳﻮآﺴﻲ ﺟﻮاﻧﻴﻠﻴﻚ ﻣﻦ اﻟﺠﻮاﻧﻴﻦ •
ﺣﻤﺾ ﺳﺎﻳﺘﻴﺪﻳﻠﻴﻚ أو دﻳﻮآﺴﻲ ﺳﺎﻳﺘﻴﺪﻳﻠﻴﻚ ﻣﻦ اﻟﺴﺎﻳﺘﻮزﻳﻦ •
ﺣﻤﺾ ﻳﻮرﻳﺪﻳﻠﻴﻚ ﻣﻦ اﻟﻴﻮراﺳﻴﻞ •
ﺣﻤﺾ دﻳﻮآﺴﻲ ﺛﺎﻳﻤﻴﺪﻳﻠﻴﻚ ﻣﻦ اﻟﺜﺎﻳﻤﻴﻦ •
• اﻟﻄﺮﻳﻘﺔ اﻟﺜﺎﻧﻴﺔ :اﺳﻢ اﻟﻨﻴﻮآﻠﻴﻮﺳﻴﺪ ﻣﻀﺎف إﻟﻴﺔ اﻟﻔﻮﺳﻔﺎت
• ﻣﺜﺎل :أدﻳﻨﻮزﻳﻦ -٥ﻓﻮﺳﻔﺎت أو دﻳﻮآﺴﻲ أدﻳﻨﻮزﻳﻦ -٥ﻓﻮﺳﻔﺎت
• ﺟﻮاﻧﻮزﻳﻦ -٥ﻓﻮﺳﻔﺎت أو دﻳﻮآﺴﻲ ﺟﻮاﻧﻮزﻳﻦ -٥ﻓﻮﺳﻔﺎت
ﺍﺭﺗﺒﺎﻁ ﺍﻟﻨﻴﻮﻛﻠﻮﺗﻴﺪﺍﺕ
ﺍﻟﻨﻴﻮﻛﻠﻮﺗﻴﺪﺍﺕ ﺍﺭﺗﺒﺎﻁ
ﺗﺮﺗﺒﻂ ﺍﻟﻨﻴﻮﻛﻠﻴﻮﺗﻴﺪﺍﺕ ﺑﻮﺍﺳﻄﺔ ﺍﻟﺮﺍﺑﻄﺔ ﺍﳌﺴﻤﺎﺓ
ﺑﺎﻟﺮﺍﺑﻄﺔ ﺍﻟﻔﻮﺳﻔﺎﺗﻴﺔ ﺛﻨﺎﺋﻴﺔ ﺍﻹﺳﱰ
A-G-T-C
´3 ´5
A G G T C G T C A T T A G
T C C A G C A G T A A T C
´5 ´3
NH2 O
7
6 5 N 1N 6
5 N
N1 7
8 8
2 3 4 9
N N 2 N 4 N 9
H2N 3
O O
5' 5'
O P O CH2 O P O CH2
O O
O 4' H H 1' O 4' H H 1'
3' 2' 2'
H H H 3' H
OH OH OH OH
−٥ −٥ א
. א א א א
O NH2
3 3
5
4
HN 4
CH N CH
5
2 2
CH CH
O N1 6 O N1 6
O O
5' 5'
O P O CH2 O P O CH2
O O
O 4' H H 1' O 4' H H 1'
2' 2'
H 3' H H 3' H
OH H OH OH
−٥ −٥
. א א א א
NH2
6 5 N
N1 7
8
2 3 4 9
N N
O O O
5'
O P O P O P O CH2
O
O O O 4' H H 1'
3' 2'
H H
OH OH
AMP
ADP
ATP
-Phosphate -Phosphate -Phosphate
ATP + 10 k Cal
ADP + 10 k Cal
AMP + 2 k Cal
adenosine
ﺍﻟﻨﻮﻭﻱ ﺍﻟﺪﻳﻮﻛﺴﻲ
ﺍﻟﺪﻳﻮﻛﺴﻲ ﺍﳊﺎﻣﺾ ﺍﻟﻨﻮﻭﻱ
ﺳﻼﺳﻞ ﺍﳊﺎﻣﺾ
ﺍﺭﺗﺒﺎﻁ ﺳﻼﺳﻞ
ﺍﺭﺗﺒﺎﻁ
ﺭﺍﻳﺒﻮﺯﻱ
ﺭﺍﻳﺒﻮﺯﻱ
ﺗﺮﺗﺒﻂ ﺳﻠﺴﻠﺘﺎﻥ ﻣﻦ ﺍﳊﺎﻣﺾ ﺍﻟﻨﻮﻭﻱ
ﺑﻮﺍﺳﻄﺔ ﺭﻭﺍﺑﻂ ﻫﻴﺪﺭﻭﺟﻴﻨﻴﺔ
)ﺭﺍﺑﻄﺔ ﺛﻨﺎﺋﻴﺔ( ﺃﺩﻧﲔ +ﺛﺎﳝﲔ
ﺟﻮﺍﻧﲔ +ﺳﻴﺘﻮﺯﻳﻦ )ﺭﺍﺑﻄﺔ ﺛﻼﺛﻴﺔ(
A G C A T
3’
P P P P OH
5’
P
34 °A
DNA. א א :(٦−٧)
DNA ﺃﺷﻜﺎﻝ ﺍﻟـ
ﻳﺴﺎري ﻳﻤﻴﻨﻲ
Z-DNA B-DNA and A-DNA
ﺃﺷﻜﺎﻝ ﺍﻟـ DNA
B-DNA A-DNA Z-DNA
ﻳﻤﻴﻨﻲ ﻳﻤﻴﻨﻲ ﻳﺴﺎري
ﻋﺸﺮة أزواج ﻣﻦ أﺣﺪ ﻋﺸﺮ زوﺟًﺎ ﻣﻦ إﺛﻨﻰ ﻋﺸﺮ زوﺟًﺎ ﻣﻦ
اﻟﻘﻮاﻋﺪ ﻓﻲ اﻟﻠﻔﺔ اﻟﻘﻮاﻋﺪ ﻓﻲ اﻟﻠﻔﺔ اﻟﻘﻮاﻋﺪ ﻓﻲ اﻟﻠﻔﺔ
اﻟﻘﻮاﻋﺪ ﻋﻤﻮدﻳﺔ ﻋﻠﻰ اﻟﻘﻮاﻋﺪ ﻏﻴﺮﻋﻤﻮدﻳﺔ ﻳﺤﺪث ﻋﻨﺪ ﺗﻜﺮار G-
اﻟﻤﺤﻮر ﻋﻠﻰ اﻟﻤﺤﻮر وﻣﺎﺋﻠﺔ C
ﺑﺰاوﻳﺔ °٢٠
ﺍﳋﻮﺍﺹ ﺍﻟﻔﻴﺰﻳﺎﺋﻴﺔ ﻟﻠـ DNA
-1ﺗﻐﻴﺮ اﻟﺘﺮآﻴﺐ اﻟﻄﺒﻴﻌﻲ Denaturation
اﻟﺘﺴﺨﻴﻦ ﻳﻌﻤﻞ ﻋﻠﻰ ﻓﻚ اﻟﺮواﺑﻂ اﻟﻬﻴﺪروﺟﻴﻨﻴﺔ ﺑﻴﻦ ﺳﻠﺴﻠﺘﻲ
اﻟﺤﻠﻮزن ﻣﻤﺎ ﻳﺆدي إﻟﻰ ﻓﺼﻠﻬﻤﺎ وﺑﺬﻟﻚ ﺗﺰﻳﺪ اﻟﻠﺰوﺟﺔ وﻳﺰﻳﺪ
اﻻﻣﺘﺼﺎص اﻟﻀﻮﺋﻲ ﻟﻸﺷﻌﺔ ﻓﻮق اﻟﺒﻨﻔﺴﺠﻴﺔ.
ﺗﻌﺮف درﺟﺔ اﻟﺤﺮارة اﻟﺘﻲ ﻳﺤﺪث ﻋﻨﺪهﺎ اﻟﺘﻐﻴﺮ اﻟﻄﺒﻴﻌﻲ ﺑﺪرﺟﺔ
اﻹﻧﺼﻬﺎر Tm
ﺗﺘﺤﺪ اﻟﺴﻠﺴﻠﺘﺎن ﻣﺮة أﺧﺮى ﻋﻨﺪ اﻟﺘﺒﺮﻳﺪ
ﺍﳋﻮﺍﺹ ﺍﻟﻔﻴﺰﻳﺎﺋﻴﺔ ﻟﻠـ DNA
-٢اﻟﻜﺜﺎﻓﺔ
ﺗﺰداد اﻟﻜﺜﺎﻓﺔ ﺑﺰﻳﺎدة اﻟﺠﻮاﻧﻴﻦ واﻟﺴﺎﻳﺘﻮزﻳﻦ ﻓﻲ اﻟﺤﻠﺰون اﻟﻤﺰدوج
)ﻟﻤﺎذا؟(
آﺜﺎﻓﺔ اﻟﺤﻠﺰون اﻟﻤﺰدوج أﻋﻠﻰ ﻣﻦ آﺜﺎﻓﺔ اﻟﺸﺮﻳﻂ )ﻟﻤﺎذا؟(
-٣اﻟﺤﺠﻢ واﻟﺸﻜﻞ
ﻣﺴﺘﻘﻴﻢ ﻏﻴﺮ ﻣﺘﻔﺮع ﺧﻴﻄﻲ ﻓﻲ اﻟﻜﺎﺋﻨﺎت اﻟﺮاﻗﻴﺔ وﺣﻠﻘﻰ ﻓﻲ اﻟﺒﻜﺘﺮﻳﺎ.
ﺍﳊﺎﻣﺾ ﺍﻟﻨﻮﻭﻱ ﺍﻟﺮﻳﺒﻮﺯﻱ RNA
-١ﺣﺎﻣﺾ ﻧﻮﻭﻱ ﺭﻳﺒﻮﺯﻱ ﺭﺳﻮﻝ m-RNA
-٢ﺣﺎﻣﺾ ﻧﻮﻭﻱ ﺭﻳﺒﻮﺯﻱ ﻧﺎﻗﻞ t-RNA
-٣ﺣﺎﻣﺾ ﻧﻮﻭﻱ ﺭﻳﺒﻮﺯﻱ ﺭﻳﺒﻮﺳﻮﻣﻲ r-RNA
اﻟﻤﺒﺪأ اﻟﻤﺮآﺰي ﻟﻠﺠﻴﻨﺎت اﻟﺠﺰﻳﺌﻴﺔ Central Dogma of Molecular Genetics
اﻟﺒﺮوﺗﻴﻨﺎت RNA DNA
ﺍﻟﺮﺳﻮﻝ mRNA
%١٠-٥
ﻳﺤﻤﻞ اﻟﺸﻔﺮة اﻟﻮراﺛﻴﺔ ﻣﻦ اﻟـ DNAﻓﻲ اﻟﻨﻮاة إﻟﻰ اﻟﺴﻴﺘﻮﺑﻼزم
ﺗﻤﺜﻞ آﻞ ﺛﻼث ﻧﻴﻮآﻠﻴﻮﺗﻴﺪات ﺷﻔﺮة ﻟﺤﻤﺾ أﻣﻴﻨﻲ وﺗﺸﻤﻰ ”ﺷﻔﺮة ”codon
ت
ﺗﺘﺮﺟﻢ اﻟﺸﻔﺮة ﺑﻌﺪ ذﻟﻚ إﻟﻰ اﻷﺣﻤﺎض اﻷﻣﻴﻨﻴﺔ ﺛﻢ اﻟﺒﺮوﺗﻴﻨﺎ ِ
ﻻ ﻳﻘﻞ ﻋﺪد اﻟﻨﻴﻮآﻠﻴﻮﺗﻴﺪات ﻋﻦ ﺛﻼﺛﺔ أﺿﻌﺎف ﻋﺪد اﻷﺣﻤﺎض اﻷﻣﻴﻨﻴﺔ اﻟﻤﻜﻮﻧﻴﺔ ﻟﻠﺒﺒﺘﻴﺪ أو
ﻟﺒﺮوﺗﻴﻦ اﻟﻤﺘﺮﺟﻢ )ﻟﻤﺎذا؟(
ﻟﻜﻞ ﺑﺮوﺗﻴﻦ mRNAﺧﺎص ﺑﻪ واﻟﺬي ﻳﺘﺤﻠﻞ ﺑﻌﺪ ﺗﺼﻨﻴﻊ اﻟﺒﺮوﺗﻴﻦ
ﺍﻟﻨﺎﻗﻞ t-RNA
أﺻﻐﺮ أﻧﻮاع اﻟـ RNA
ﻳﺘﻜﻮن ﻣﻦ ٩٠-٧٥ﻧﻴﻮآﻠﻴﻮﺗﻴﺪ أﺣﺎدي
ﻳﻤﺜﻞ %٢٠-١٠ﻣﻦ ﻣﺠﻤﻮع اﻟـ RNA
ﻳﻘﻮم ﺑﻨﻘﻞ اﻷﺣﻤﺎض اﻷﻣﻴﻨﻴﺔ ﻣﻦ اﻟﺴﻴﺘﻮﺑﻼزم إﻟﻰ ﻣﻮﻗﻊ ارﺗﺒﺎﻃﻬﺎ ﻓﻲ اﻟﺮﻳﺒﻮزوﻣﺎت ﺣﺴﺐ
ﺗﺴﻠﺴﻞ اﻟﺸﻔﺮة اﻟﻮراﺛﻴﺔ
ﻳﺤﺘﻮي ﻋﻠﻰ ﺷﻔﺮة ﻣﻀﺎدة ” “anticodonﻣﻜﻤﻠﺔ ﻟﻠﺸﻔﺮة اﻟﻮراﺛﻴﺔ ﻓﻲ اﻟﺮﺳﻮل
ﻳﻮﺟﺪ ﻋﻠﻰ اﻷﻗﻞ ﻧﺎﻗﻞ واﺣﺪ ﻟﻜﻞ ﺣﻤﺾ أﻣﻴﻨﻲ.
ﻋﻠﻰ ﻋﻜﺲ اﻟﺮﺳﻮل ﻓﺈن tRNAﻻ ﻳﺘﺤﻠﻞ ﺑﻌﺪ ﺗﺼﻨﻴﻊ اﻟﺒﺮوﺗﻴﻦ
ﺍﻟﻨﺎﻗﻞ t-RNA
ﻣﻮﺿﻊ ﺇﺭﺗﺒﺎﻁ ﺍﳊﻤﺾ ﺍﻷﻣﻴﻨﻲ
اﻷﻏﺼﺎن
اﻟﻌﻘﺪ Stem
Loop
ﺍﻟﺸﻔﺮﺓ ﺍﳌﻀﺎﺩﺓ
ﺍﻟﺮﺍﻳﺒﻮﺳﻮﻣﻲ rRNA
آﺒﻴﺮ اﻟﺤﺠﻢ •
ﻳﻤﺜﻞ %65-60ﻣﻦ ﻣﺤﺘﻮى اﻟـ rRNA •
ﻳﻮﺟﺪ ﻣﺮﺗﺒﻂ ﺑﺒﺮوﺗﻴﻨﺎت ﻧﻮوﻳﺔ )اﻟﺮاﻳﺒﻮﺳﻮم( •
ﻋﻠﻰ ﻋﻜﺲ اﻟﺮﺳﻮل ﻓﺈن rRNAﻻ ﻳﺘﺤﻠﻞ ﺑﻌﺪ ﺗﺼﻨﻴﻊ •
اﻟﺒﺮوﺗﻴﻦ