ZCCHC8

ZCCHC8
Ідентифікатори
Символи	ZCCHC8, zinc finger CCHC-type containing 8, PFBMFT5
Зовнішні ІД	OMIM: 616381 MGI: 1917900 HomoloGene: 32349 GeneCards: ZCCHC8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • нуклеоплазма • ядерні тільця • клітинне ядро • ядерце • TRAMP complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55596	70650
Ensembl	ENSG00000033030	ENSMUSG00000029427
UniProt	Q6NZY4	Q9CYA6
RefSeq (мРНК)	NM_017612 NM_001350935 NM_001350936 NM_001350937 NM_001350938	NM_027494
RefSeq (білок)	NP_060082 NP_001337864 NP_001337865 NP_001337866 NP_001337867	NP_081770
Локус (UCSC)	Хр. 12: 122.47 – 122.5 Mb	Хр. 5: 123.84 – 123.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZCCHC8 (англ. Zinc finger CCHC-type containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 707 амінокислот, а молекулярна маса — 78 577.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAEVYFGDL		ELFEPFDHPE		ESIPKPVHTR		FKDDDGDEED		ENGVGDAELR
ERLRQCEETI		EQLRAENQEL		KRKLNILTRP		SGILVNDTKL		DGPILQILFM
NNAISKQYHQ		EIEEFVSNLV		KRFEEQQKND		VEKTSFNLLP		QPSSIVLEED
HKVEESCAIK		NNKEAFSVVG		SVLYFTNFCL		DKLGQPLLNE		NPQLSEGWEI
PKYHQVFSHI		VSLEGQEIQV		KAKRPKPHCF		NCGSEEHQMK		DCPMPRNAAR
ISEKRKEYMD		ACGEANNQNF		QQRYHAEEVE		ERFGRFKPGV		ISEELQDALG
VTDKSLPPFI		YRMRQLGYPP		GWLKEAELEN		SGLALYDGKD		GTDGETEVGE
IQQNKSVTYD		LSKLVNYPGF		NISTPRGIPD		EWRIFGSIPM		QACQQKDVFA
NYLTSNFQAP		GVKSGNKRSS		SHSSPGSPKK		QKNESNSAGS		PADMELDSDM
EVPHGSQSSE		SFQFQPPLPP		DTPPLPRGTP		PPVFTPPLPK		GTPPLTPSDS
PQTRTASGAV		DEDALTLEEL		EEQQRRIWAA		LEQAESVNSD		SDVPVDTPLT
GNSVASSPCP		NELDLPVPEG		KTSEKQTLDE		PEVPEIFTKK		SEAGHASSPD
SEVTSLCQKE		KAELAPVNTE		GALLDNGSVV		PNCDISNGGS		QKLFPADTSP
STATKIHSPI		PDMSKFATGI		TPFEFENMAE		STGMYLRIRS		LLKNSPRNQQ
KNKKASE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Sloan K.E., Schneider C., Watkins N.J. (2012). Comparison of the yeast and human nuclear exosome complexes. Biochem. Soc. Trans. 40: 850—855. PMID 22817747 DOI:10.1042/BST20120061

Див. також

• Хромосома 12