CAPN8

CAPN8
Ідентифікатори
Символи	CAPN8, nCL-2, calpain 8
Зовнішні ІД	MGI: 2181366 HomoloGene: 15643 GeneCards: CAPN8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type peptidase activity • зв'язування з іоном металу • calcium ion binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинний • цитоплазма Біологічний процес • протеоліз • травлення Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	388743	170725
Ensembl	ENSG00000203697	ENSMUSG00000038599
UniProt	A6NHC0 A3QK37	Q91VA3
RefSeq (мРНК)	NM_001143962	NM_001145806 NM_130890
RefSeq (білок)	NP_001137434	NP_001139278 NP_570960
Локус (UCSC)	Хр. 1: 223.54 – 223.67 Mb	Хр. 1: 182.39 – 182.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAPN8 (англ. Calpain 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 79 144.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAQAAGVSR		QRAATQGLGS		NQNALKYLGQ		DFKTLRQQCL		DSGVLFKDPE
FPACPSALGY		KDLGPGSPQT		QGIIWKRPTE		LCPSPQFIVG		GATRTDICQG
GLGDCWLLAA		IASLTLNEEL		LYRVVPRDQD		FQENYAGIFH		FQFWQYGEWV
EVVIDDRLPT		KNGQLLFLHS		EQGNEFWSAL		LEKAYAKLNG		CYEALAGGST
VEGFEDFTGG		ISEFYDLKKP		PANLYQIIRK		ALCAGSLLGC		SIDVSSAAEA
EAITSQKLVK		SHAYSVTGVE		EVNFQGHPEK		LIRLRNPWGE		VEWSGAWSDD
APEWNHIDPR		RKEELDKKVE		DGEFWMSLSD		FVRQFSRLEI		CNLSPDSLSS
EEVHKWNLVL		FNGHWTRGST		AGGCQNYPAT		YWTNPQFKIR		LDEVDEDQEE
SIGEPCCTVL		LGLMQKNRRW		RKRIGQGMLS		IGYAVYQVPK		ELESHTDAHL
GRDFFLAYQP		SARTSTYVNL		REVSGRARLP		PGEYLVVPST		FEPFKDGEFC
LRVFSEKKAQ		ALEIGDVVAG		NPYEPHPSEV		DQEDDQFRRL		FEKLAGKDSE
ITANALKILL		NEAFSKRTDI		KFDGFNINTC		REMISLLDSN		GTGTLGAVEF
KTLWLKIQKY		LEIYWETDYN		HSGTIDAHEM		RTALRKAGFT		LNSQVQQTIA
LRYACSKLGI		NFDSFVACMI		RLETLFKLFS		LLDEDKDGMV		QLSLAEWLCC
VLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1