AI4S - AlphaFold: 使用 自定义复合物(Multimer)模版 预测蛋白质结构 教程 (2)

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在 AlphaFold 预测蛋白质三维结构中，结构 模版(Template) 起着关键作用：

• 蛋白质结构模板：已知的蛋白质结构的集合，这些已知结构通常来自实验数据或者预测结构，使用这些已知结构作为模板，以帮助预测未知蛋白质的三维结构。
• 模板比对：首先，将目标蛋白质的氨基酸序列与已知结构模板进行比对。通过比对，可以找到与目标蛋白质相似的模板，从而为预测提供参考。
• 模板信息的利用：使用模板信息来约束预测模型。具体来说，将目标蛋白质的序列与模板对齐，以确定哪些部分与已知结构相似。模板信息有助于更准确地预测目标蛋白质的结构，特别是在缺乏实验数