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原创 生信宝典:生物信息学习系列教程、视频、资源

欢迎关注天下博客:http://blog.genesino.com/2100/01/shengxinbaodian/生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需...

2018-01-31 10:02:40 10706 3

转载 快讯:分子生药学发展30周年研讨会暨第十三届分子生药学暑期研讨会顺利召开

苏州市卫生健康委员会党组书记、主任章鸣林、中国中医科学院副院长舒静、研究生院副院长马晓北、教育管理处副处长毛超一、福建农林大学校长兰思仁、甘肃中医药大学副校长晋玲、西湖大学副校长许田、中国中西医结合学会分子生药学专业委员会主任委员、中国中医科学院医学实验中心副主任袁媛等出席开幕式。周年研讨会暨第十三届分子生药学暑期研讨会围绕中药道地性、中药生物技术、中药合成生物学、中医药数据科学、中药分子鉴定等方向,设置了。家高校、科研院所、医院及企业等单位的专家、学者和研究生代表共计。点击图片直达文字对应教程。

2025-08-11 21:00:54 10

转载 2025 年8月15-17 | 家系、肿瘤临床基因组/外显子组数据分析实战

为满足广大读者进一步学习的需求,易生信课程开发团队 (现运营《生信宝典》和《聊生信》两个公众号)经长期规划,筹备和专家研讨,现组织和开展临床基因组学专题培训课程,以便进一步普及和交流临床基因组学分析技术,手把手带您快速入门,节约宝贵的时间,助力科研成果早日产出。使用R语言等统计与可视化工具,绘制常用生信相关图形,包括:热图 (变异水平),maftools图 (基因水平),基因的结构、变异位置及结构域标记 (棒棒糖图),基因组Circos图,IGV基因组浏览器,PPI网络图,基因功能的富集结果图。

2025-08-11 21:00:54 10

转载 iMeta | 被引超10500次,发文319篇,平均引用32.95,百引耗时4天(2025/8/3)

根据 Dimensions 网站统计,截止2025年8月3日,iMeta 己发表论文319篇,被引10511,平均引用32.95,百引耗时4天。引超4200次,百引耗时14天;● iMeta | 被引超1400次,发文122篇,平均引用11.55,百引耗时18天(2023/10/5)● iMeta | 被引超2100次,发文151篇,平均引用13.96,百引耗时16天(2024/1/23)● iMeta | 被引超2800次,发文179篇,平均引用15.88,百引耗时16天(2024/4/17)

2025-08-10 21:02:16 22

转载 iMetaOmics | 中科院城环所叶国注组-解析微塑料暴露下肠道微生物富集特征及其功能紊乱

点击蓝字 关注我们聚苯乙烯微塑料暴露诱发肠道微生物富集条件下氧化还原稳态、神经和激素功能相关代谢紊乱特征iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 期刊:iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70043● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70043● 2025年7月23日,中国科学院城市环境研究所叶国注、云谱康(

2025-08-10 21:02:16 88

转载 华中农大校长严建兵等入选!第十八届谈家桢生命科学奖候选名单揭晓

经由谈家桢生命科学奖奖励委员会委员、中国科协生命科学学会联合体主席团成员和谈家桢生命科学奖评审专家委员会委员组成的函评专家评审,经投票进入评审阶段的被推荐候选人包括:谈家桢生命科学成就奖6名、谈家桢生命科学国际合作奖3名、谈家桢临床医学奖7名、谈家桢生命科学产业化奖4名、谈家桢生命科学创新奖22名。,男,1972年3月出生,天津医科大学党委副书记、校长,天津医科大学肿瘤医院院长,教授、主任医师。,男,1963年10月出生,中国科学院院士,香港中文大学校长、教授,香港科学院院长。

2025-08-09 21:02:01 318

转载 iMeta | 尹佟明组和汪阳东组-开发用于细胞器基因组的高效图形化组装工具包PMAT2

点击蓝字 关注我们PMAT2:用于细胞器基因组的高效图形化组装工具包iMeta主页:http://www.imeta.science方法论文● 期刊: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70064● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70064● 2025年7月1日,南京林业大学尹佟明和中国林科院汪阳东等在iMeta在线发表了题为“PMAT2:

2025-08-08 21:02:53 39

转载 J Adv Res|中国医学科学院药用植物研究所孙晓波/罗云研究员团队:缺血性卒中内细胞来源的细胞外囊泡促进神经元内质网应激损伤

缺血性卒中具有高发病率、高死亡率、高致残率、高复发率等特点。近年来仅围绕单一细胞损伤的保护已不足以开发发病机理复杂的脑卒中创新药物,血管内皮细胞与神经元等细胞之间通讯成为研究热点。最后,基于神经元损伤保护策略,研究者从已上市神经保护药物中筛选并证实了丁苯肽能够靶向并抑制。在缺血性脑卒中发生与发展中扮演重要作用,但阐明其分子机制以及药物干预策略具有重要的意义。介导的神经元损伤分子机制,更揭示了其能够作为抗缺血性脑卒中新药研发新的治疗靶点的潜力。”的研究论文,主要介绍了大脑微血管内皮细胞来源的细胞外囊泡中。

2025-08-07 21:02:49 72

转载 iMetaOmics | 李英/赵江潮组-基于HiFi测序的宏基因组组装策略在MAG构建中接近单菌基因组的组装精度

点击蓝字 关注我们基于HiFi测序的宏基因组组装策略在MAG构建中接近单菌基因组的组装精度iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/方法论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70041● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70041● 2025年7月8日,佛山大学李英、邓飞龙和华南农业大学赵江潮等在iMetaOmics在线发表了题为“HiF

2025-08-06 21:02:22 61

转载 iMeta系列期刊青年编委招募 (IF 33.2中科院双一区)

目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2024年6月获得首个影响因子23.8,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!单篇第一或通讯作者论文IF > 10,且2篇或3篇累计IF > 20 (共同第一作者IF除以作者顺序,共同通讯作者顺序倒数)前沿交叉学科发展,期刊特色包括双语全文和视频、可重复分析、图片打磨、青年编委、

2025-08-06 21:02:22 46

转载 Adv Sci丨中科院冯桂海/周琪/王鹏飞/马英克等研究发现FemXpress可通过X连锁SNP解析单细胞X染色体失活异质性

至关重要的是,在每个器官的同一种细胞类型中,我们发现了一些由于失活X染色体的亲本来源差异而导致表达差异的基因。在每个器官中,我们识别出候选的XCI逃逸基因,并在每种细胞类型中观察到与XCI起源相关的基因表达差异,这些差异可能导致表型变异。在本研究中,我们展示了 FemXpress,这是一种用于研究雌性 scRNA-Seq 样本中 XCI 异质性的分析工具,它通过基于 X 染色体上表达基因的连锁单核苷酸多态性 (SNP) 对细胞进行聚类。高颜值免费 SCI 在线绘图。点击图片直达文字对应教程。

2025-08-04 21:02:49 108

转载 新课第五期,9月 | 单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源

代码,记录了分析的过程和细节,存档在计算机中,便于使用、回顾、审查、优化、发表和共享。世代周期短,进化/演化迅速。对于其它物种,如大型动/植物基因组 (尤其是跨物种),则不适用此课程,原因包括:实施难度 (动/植物基因组的组装难度更大),分析模块 (动/植物无需做传播与溯源分析)及中间数据 (本课程主要利用核心基因组构树,而非同源基因)等。本课程的技术与理论体系,也有助于微生物实验室/课题组:建立系统的基因组分析流程,完善质量管理体系,培养相关生信人才,提示软件、流程及数据库的开发方向和评估方法。

2025-08-03 21:01:57 64

转载 EasyNanoMeta | 纳米孔宏基因组4基因功能注释与定量方法(基于reads)

Abricate是一种基于Blastn的功能基因识别工具,可根据功能基因的同源性进行已知功能基因及其同源基因的鉴定,但是abricate不能对鉴定的功能基因进行定量,在EasyNanoMeta中,我们引入了纳米孔宏基因组数据分析中常用的功能基因定量单位gc/Gb,提供了基于abricate的基因定量脚本,使我们可以直接基于纳米孔宏基因组原始reads进行功能基因定量。纳米孔宏基因组数据分析系列教程4----基于reads的功能基因注释及定量。一、使用abricate识别三代宏基因组测序数据中的耐药基因。

2025-08-03 21:01:57 63

转载 重磅!2025年度国家科学技术奖受理名单公布,1525项!8项不予受理

公示期间,任何单位或者个人对公示项目持有异议的,应当按照《国家科学技术奖励条例实施细则》等有关规定,以书面方式提出,并提供必要的证据材料。根据《国家科学技术奖励条例》《国家科学技术奖励条例实施细则》《国家科学技术奖提名办法》《国家科学技术奖励工作办公室关于2025年度国家科学技术奖提名工作的通知》规定,国家自然科学奖项目289项,国家技术发明奖项目334项(通用项目257项,专用项目77项),国家科学技术进步奖项目911项(通用项目767项,专用项目144项)最全1000+植物核基因组数据库IMP。

2025-08-02 21:01:21 155

转载 Plant Journal ||西北农林科技大学麻鹏达教授团队和阿坝师范学院杨子松教授团队合作发表丹参活性成分合成和调控综述文章

材,广泛用于心脑血管疾病、肝脏损伤、肿瘤及神经系统疾病的治疗,其活性成分包括脂溶性的丹参酮类和水溶性的丹酚酸类。近年来,随着基因组测序与多组学技术的发展,研究人员在揭示其活性成分生物合成途径及调控机制方面取得了。合成中的作用,阐明了多条信号通路(如茉莉酸、脱落酸和水杨酸信号通路)如何共同调控相关基因表达。)中丹参酮和酚酸活性成分的合成途径及其调控的最新研究进展。该研究为丹参的分子育种和代谢工程奠定了理论基础,对推动。系统总结了丹参酮和酚酸类物质合成途径的解析工作,并。高颜值免费 SCI 在线绘图。

2025-08-01 21:02:22 449

转载 Nat Genet | 陈明远/张世华等团队利用单细胞和空间转录组学联合解析揭示复发鼻咽癌放疗抵抗与免疫逃逸发生机制

该研究对24例患者的39个肿瘤样本开展单细胞和空间转录组测序,对T、B、髓系、成纤维等细胞类型进行了亚类分析,对空间点位进行细胞成分解卷积,评估关键信号通路的活性,并配合多种基因集富集分析,系统描绘了初治与复发鼻咽癌TME的差异图谱。CAFs通过分泌IV型胶原与NPC细胞表面整合素受体通过COL IV-ITGA2相互作用,激活FAK-AKT信号通路激活放疗抵抗通路,(3)确定了rNPC的免疫逃逸发生机制,以上发现有望为复发鼻咽癌患者的治疗提供新的靶向治疗策略。显著富集,与患者不良预后有关,(2)MCAM+

2025-07-31 21:01:43 417

转载 iMeta | 宁大一院陈夏组-肠道细菌及代谢物治疗多囊卵巢综合征

点击蓝字 关注我们肠道微生物源性的高原儿茶酸改善多囊卵巢综合征iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70065● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70065● 2025年7月15日,宁波大学第一附属医院陈夏、南方医科大学余光创、澳

2025-07-31 21:01:43 309

转载 iMeta大会2025 | 人才成长论坛报告简介(8.23-25, 湖北中医药大学,二轮优惠/团购报名最后2周)

iMeta大会2025 人才成长方向分会场报告iMeta (宏)期刊是生物医学交叉学科期刊,主编刘双江和傅静远教授,影响因子33.2,全球SCI期刊排名65/22249 (前千分之三),中国大陆排名 5/585。子刊iMetaOmics(宏组学)的主编赵方庆和于君教授,定位IF>10的生物医学交叉学科综合期刊;子刊iMetaMed(宏医学)的主编是朱依谆和郭洪波教授,定位IF>15的医学综合期刊,欢迎投稿!希望在大家共同努力下,8年内创办10本IF>10的子刊,形成可替代生物医学顶刊Cell系列的中国解决方

2025-07-30 21:01:24 139

转载 昆植所黎胜红/刘燕团队Sci Adv:靶向GAPDH的天然抗银屑病二倍半萜及其免疫调节机制

然而,大多数植物天然产物的自然作用与其药理活性之间的内在相关性被忽视,使得这些天然产物作为创新药物或杀虫剂的利用在很大程度上尚未得到探索。考虑到不同生物体中靶蛋白的结构相似性和功能相似性,破译植物天然产物的生态作用和分子靶标可能会揭示识别其潜在药理活性的潜力。在自然界中,植物通过产生特殊代谢产物来抵御昆虫和病原体的侵袭,这些化合物往往具有独特的化学结构和生物活性。此外,植物天然产物是开发创新药物和杀虫剂的宝库,例如紫杉醇、青蒿素、阿司匹林、吗啡、奎宁、除虫菊酯和印楝素。

2025-07-30 21:01:24 276

转载 hLife | 王军研究团队评述AI将点亮微生物研究的未知领域

当前虽有如KEGG等已涵盖了大量模式生物代谢路径的在线数据库,但对非模式生物和复杂微生物群落的注释仍非常有限,而且即便在已经研究非常透彻的模式生物中,也仍有许多代谢产物未被注释、功能不明。由高福院士、董晨院士和Jules A. Hoffmann教授(2011诺奖获得者)领衔,是中国科学院微生物研究所主办,中国生物工程学会,浙江大学陈廷骅大健康学院,西湖大学医学院,上海市免疫治疗创新研究院和广州霍夫曼免疫研究所联合支持,与国际出版商爱思唯尔合作的健康科学领域综合性英文期刊。微生物学的复杂性,远超我们的想象。

2025-07-29 21:02:38 71

转载 iMeta大会2025 | 微生物方向8位领军人才报告简介(8.23-25, 湖北中医药大学,二轮优惠/团购报名最后2周)

沈锡辉,西北农林科技大学生命科学学院教授、博士生导师,获国家杰出青年科学基金支持(2017),入选“万人计划”(2019)、科技部中青年科技创新领军人才推进计划(2018)和陕西省特支计划(2018),享受国务院政府特殊津贴(2024)。为了理解相关机制,我们将变形链球菌中的聚酮、非核糖体肽和二者杂合类次级代谢产物基因簇分成了八种类型,并致力于获取相关的次级代谢基因簇的产物,解析其生物合成机制和活性,评价它们的活性,并系统地评估它们在与其它微生物和口腔环境互作中的作用,以及促进龋齿形成的机制。

2025-07-29 21:02:38 127

转载 iMeta大会2025 | 植物方向分会场报告

iMeta大会2025 植物方向分会场报告过去五年,中国从零开始发展或创办IF>20的高水平期刊24本,达到了英美高水平期刊数目的一半,创造了学术期刊世界第三极,打破了英美在英文学术期刊的百年垄断。未来如何团结国内优势学科,建立国际一流影响力的学术编辑和出版体系,实现CNS顶刊国产替代是本次会议讨论的重要议题。iMeta (宏)期刊是生物医学交叉学科期刊,主编刘双江和傅静远教授,影响因子33.2,全球SCI期刊排名65/22249 (前千分之三),中国大陆排名 5/585。子刊iMetaOmics(宏组学)

2025-07-28 21:01:36 164

转载 中华中医药学会—中医药重大科学问题、工程技术难题和产业技术问题

高颜值免费 SCI 在线绘图。最全植物基因组数据库IMP。点击图片直达文字对应教程。

2025-07-28 21:01:36 48

原创 通过小样本学习利用少量湿实验数据提升蛋白质语言模型效率

精确建模蛋白质适应度景观 (protein fitness landscapes)对蛋白质工程至关重要。预训练蛋白质语言模型在无需湿实验数据的情况下已实现顶尖水平的蛋白质适应度预测,但其准确性和可解释性仍有限制。而传统监督深度学习模型需大量标记训练样本实现性能提升,存在实际应用壁垒。本研究提出FSFP训练策略,能在极端数据稀缺条件下高效优化蛋白质语言模型的适应度预测。该策略融合元迁移学习、排序学习与参数高效微调技术,仅需目标蛋白的数十个标记单点突变体即可显著提升多种蛋白质语言模型性能。基于87个深度突变扫描

2025-07-28 10:50:53 752

原创 通用温度感知语言模型用于设计具备增强稳定性和活性的蛋白质

设计兼具高稳定性和高活性的蛋白质突变体是蛋白质工程中关键而富有挑战的任务。本文提出的深度学习模型无需特定蛋白的预实验突变数据,即可设计出稳定性与活性提升的蛋白质突变体。基于温度感知语言建模技术,PRIME在涵盖283套蛋白质检测实验的公共突变数据集上展现出超越现有最优模型的预测能力。通过对五种蛋白质的验证,我们评估了PRIME推荐的30至45个单点突变对多种蛋白特性的影响,包括热稳定性、抗原-抗体结合亲和力、非天然核酸聚合能力及极端碱性耐受性。所有测试蛋白质中,超过30%的PRIME推荐突变体在目标特性上显

2025-07-28 10:50:53 1035

转载 突破重瓣花育种瓶颈!上海师大张辉团队创制出极具观赏性的“花中生花”型重瓣矮牵牛

结果显示,所有通过营养繁殖获得的新植株均完整保留了母体的重瓣特征,未出现性状分离或退化现象,表明该重瓣性状可通过无性繁殖方式稳定传代,特别是“花中生花”型重瓣花,其中心不断生长出新的花器官,具有更强的层次感和视觉冲击力,在园艺市场尤为稀缺。,提示它们可能参与调控花决定性及瓣化过程,为后续创制重瓣花品种提供了新的潜在分子靶点。中其在瓣状器官中的表达显著下降,接近花瓣表达水平,进一步支持其表达。中,它们在瓣状器官中的表达显著升高,接近或达到花瓣水平。中,这两基因的表达水平显著下降,分别为野生型的。

2025-07-27 21:01:28 145

转载 生男生女并不随机!哈佛大学最新发现:母亲年龄和基因,会影响孩子性别

现象,具体来说,已生育了一个男孩的女性,她第二个孩子是还男孩的概率为 57%,已生育两个男孩的女性,她第三个孩子还是男孩的概率为 58%,已生育三个男孩的女性,她第四个孩子还是男孩的概率为。同样,已生育一个女孩的女性,她第二个孩子还是女孩的概率为 53%,已生育两个女孩的女性,她第三个孩子还是女孩的概率为 55%,已生育了三个女孩的女性,她第四个孩子还是女孩的概率为。我们之前认为,每个孩子的出生是独立事件,因此,无论之前生育的孩子性别如何,都不影响下一个孩子的性别,其是男是女的概率应该依然是 50%。

2025-07-26 21:01:55 394

转载 Nature Genetics | 浙江大学叶楚玉课题组发表“禾谷类小作物组学研究”观点综述

目前禾谷类小作物组学研究的目的或性状大多聚焦在抗旱、耐热、耐盐等抗逆性方面,且这些研究往往停留在记录基因表达、蛋白质或代谢物的简单变化层面,很少深入探究其背后的作用机制,导致实际应用价值有限;论文构建了一个禾谷类小作物及其野生近缘种多组学数据的数据库,共纳入了来自15个物种的225个基因组,5674份已发表的RNA-seq数据(提供多组织表达谱),46个大规模的群体变异组(进行了SNP鉴定),181个已验证的功能基因信息等,旨在建立一个开放且可持续的平台,以推动对禾谷类小作物的研究。

2025-07-25 21:02:09 120

转载 知名高校植物实验室没钱了,失业“青椒”打算去开网约车

美国国家科学基金会5月数据显示,若国会通过白宫提出的削减方案,其资助的早期科研人员数量可能会锐减78%——从当前财年的95700名本科生、研究生和博士后,锐减至2026年的21400人。类似西蒙实验室的沮丧“谈话”,正在美国各地上演:美国联邦政府已暂停或终止了数十亿美元的拨款,并提议在下一财年将主要研究机构的经费削减40%以上,且试图削减支付给高校的间接成本(尽管目前尚未成功)。对此,杜克大学回复称,校方正在评估各项财务方案,“以最大限度保留岗位”,教职人员减薪是一个方面,但尚未做出最终决定。

2025-07-25 21:02:09 160

转载 科技部重点专项:论文发表在国内期刊比例不低于50% (什么是国内期刊?)

、国家科学技术奖励工作办公室(https://www.nosta.gov.cn/pc/zh/yclm/tzgg/1691.shtml)2025年度第三批项目设立5个指南方向,支持与4个国家开展科技合作,拟支持项目数约21个,国拨经费总概算1.02亿元人民币。iMeta大会2025 | 开放研究人员/博后/研究生报告申请 (8.23-25, 湖北中医药大学,早鸟价最后1天)虽然没有CN号,但由我国机构和个人实际控股的期刊。高颜值免费 SCI 在线绘图。最全植物基因组数据库IMP。点击图片直达文字对应教程。

2025-07-24 21:02:37 155

转载 ‌J Ethnopharmacol‌ | 中国中医科学院袁媛课题组揭示蒿属外来药材中亚苦蒿抗抑郁的作用机制

结果显示当GABRB3或SLC6A4的表达被特异性降低后,AAEO对细胞的保护作用显著减弱,细胞活力、乳酸脱氢酶的释放、细胞凋亡以及线粒体膜电位的异常均无法得到改善,该结果直接证实了GABRB3与SLC6A4是AAEO发挥神经保护作用的重要靶标。并且在旷场实验和强迫游泳实验中,AAEO治疗后的小鼠相较于模型小鼠的抑郁行为均有显著改善。综上,本研究成功预测并验证了AAEO的多成分、多靶点的抗抑郁作用,这些结果为中亚苦蒿治疗抑郁症提供了新的证据,也为蒿属药用资源中亚苦蒿的进一步开发利用奠定了基础。

2025-07-24 21:02:37 88

转载 Mol Plant | 无患子科皂苷生物合成基因簇的进化和功能表征

更有趣的是,编码CYP450的氧化基因和编码糖基化的UGT的基因位于BAS的共线块内,在无患子科中形成BGC。使用农杆菌介导的烟草叶中的瞬时表达系统将BAS与截短的HMGR共表达,验证BAS的功能。在所有UGT87A介导的反应中观察到一个新的产物峰,峰显示出相似的MS/MS谱图,尤其是在617.405和663.415处的m/z,对应于果皮组织的谱图。然而,发现UGT87As保存在保守的共线块中,并且保持良好的共线性,不仅在携带BGC的Sapindales物种的基因组中,而且在许多其他双子叶植物物种中。

2025-07-23 21:01:34 83

转载 Nature | 清华大学刘玉乐团队开创简单高效人工设计植物抗病基因的新策略

近年来,重塑植物免疫受体以获得新型抗病基因,已成为应对植物病害严重威胁的重要策略。45%的植物病毒编码其侵染所必需的蛋白酶,大量细菌、真菌、卵菌、线虫和刺吸式昆虫也依赖向植物细胞分泌蛋白酶致病。在识别病原入侵后可组装形成抗病小体,在膜上形成钙离子通道,激活免疫反应,这一过程依赖其。然而,现有的方法受限于植物病虫的快速进化,往往难以实现广谱持久的抗病。多种病毒的广谱抗性,并且抗性很强,甚至表现为极端抗性,病毒不能建立侵染。由于选用的病毒蛋白酶识别切割位点高度保守,预计构建的抗病基因可。

2025-07-23 21:01:34 457

转载 JIPB | 综述:植物环境适应性进化的遗传变异

陆地植物从水生祖先演化过程中,主要通过水平基因转移(HGT)和全基因组复制(WGD)获得大量新基因,构建了复杂的分子通路(如光信号、激素、细胞壁合成、次生代谢、抗逆),以应对陆地环境的复杂性(如干旱、UV、温度波动)。后续的WGD事件(尤其围绕白垩纪-古近纪边界)进一步通过功能分化促进了维管植物(特别是被子植物)的多样化与环境适应(如种子发育、抗性、油脂合成)。水稻籼粳亚种)的重要驱动力,常伴随生殖隔离。如花器官结构(番茄自花授粉)、果皮颜色(苹果、草莓)、刺(茄科植物)等也受特定基因等位变异的影响。

2025-07-22 21:01:54 201

转载 Bio-protocol | 近一年“生物信息”实验方案合集

Bio-101 是Bio-protocol旗下一个中文生命科学实验方案的共享平台,通过与上百个国内优秀科研团队的合作,已出版了多本同行评审、免费获取的中文实验方案电子书。多种方法,重点展示不同生物样本的数据处理与组学分析、细胞显微成像技术优化,以及从序列组装、差异分析到代谢网络构建的实用工具与流程,希望能为研究人员提供思路与参考。,强调使用无需外源参照物的siQ-ChIP和标准化覆盖度方法,实现更严谨、可复现的蛋白–DNA互作信号定量与比较,适用于多种物种的研究。

2025-07-22 21:01:54 205

转载 师从王佳伟研究员,博士生一作发Cell,改变三个基因即可实现植物多年生与一年生之间互相转换!获评百篇优秀博士学位论文

此外,由于多年生作物具有发达的根系,能保证高的水肥利用,减少土壤流失,并将大气中的碳固定在土层中,因此设计多年生十字花科植物也将有利于我国农业的可持续发展和双碳目标的实现。通过对亲本和F1代植物的RNA-seq和H3K27me3 ChIP-seq实验,发现一年生小花糖芥的FLC类MADS-box基因在春化后更倾向于被稳定抑制,而来自多年生内华达糖芥的基因在春化后则倾向于重置,这一差异是多次结实多年生植物生活习性建立的核心分子基础,并由基因自身的特异序列所决定。,并利用高通量测序技术确定每个单株的基因型。

2025-07-21 21:00:46 280

转载 iMetaOmics | 广中医苏祓忧组-阿尔茨海默病失智行为精神症状中的微生物变化

点击蓝字 关注我们电针重塑了与阿尔茨海默病失智行为精神症状相关的微生物共现网络iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 期刊: iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70035● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70035● 2025年7月2日,中国广州中医药大学苏祓忧等在iMetaOmics在线发表了题为“E

2025-07-20 21:01:05 225

转载 点赞iMeta编委-清华大学李梢!欧洲著名大学首次将最高学术荣誉授予中医药人!

对于德布勒森大学给予自己“网络药理学之父”的评价,李梢谦虚地表示:“数据和人工智能等新兴信息技术,为中医药的守正创新提供了前所未有的机遇。“将生物信息学与中医药结合,通过学科交叉开拓网络药理学、中医药人工智能等新方向,不仅是我个人在推动中医药现代化上取得的进展,也可为中医药个体化诊疗提供科学证据,为科学理解中医药特色内涵提供一条新途径。李梢希望,在中医药与现代科技结合的道路上,自己能够带领团队继续取得新的突破,将千年药香与数据代码相融合,孕育出中医药走向未来的新方向,也为全球医学事业发展注入“中医智慧”。

2025-07-20 21:01:05 136

转载 iMeta | 黄耀伟/朱书组-解析脆弱拟杆菌通过胆盐水解酶调控石胆酸代谢拮抗猪丁型冠状病毒感染的机制

点击蓝字 关注我们肠道菌群-胆汁酸轴通过靶向细胞受体氨肽酶N抑制一种新发冠状病毒的感染iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70061● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70061● 2025年7月3日,华南农业大学黄耀伟团队和浙江大学朱书团队等在iMeta在线发表

2025-07-18 21:01:54 305

转载 高月:从杏林春暖、橘井泉香,到姓军为战、强国为民,践行军事中医药创新

刚入学时懵懂的她,渴求知识的给养,一本《黄帝内经》,一棵香樟树,陪伴她走过春华秋实,看遍夏蝉冬雪。历经20年,她带领团队成功研制了抗高原缺氧新药“红益胶囊”,能够帮助高原官兵缓解气血两虚所致的头晕目眩,胸痹心痛,神疲乏力,心悸倦怠,胸闷气短等症状,明显改善高原缺氧条件下血氧饱和度的降低,且药物安全性好,特别适用于防治高原缺氧所致的疲劳综合征。高月表示,作为军事中医药的科研工作者,身着戎装,是荣誉,是责任,更是使命,她将继续守正创新,重犁深耕,为团队修身,为事业立命,为往圣继绝学,砥砺奋进续华章。

2025-07-17 21:02:17 125

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition I. Clustering, II. Document retrieval and representation, III. Email surveillance and filtering, and IV. Anomaly detection. 著名大师Michael W. Berry的经典力作!

2010-03-02

Masterminds of programming

  Description    Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. Think along with Adin D. Falkoff (APL), James Gosling (Java), Bjarne Stroustrup (C++), and others whose vision and hard work helped shape the computer industry. You'll find advice you can apply to systems you're developing, even if you don't use the specific languages being discussed.   Full Description   Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. In this unique collection, you'll learn about the processes that led to specific design decisions, including the goals they had in mind, the trade-offs they had to make, and how their experiences have left an impact on programming today. Masterminds of Programming includes individual interviews with:   * Adin D. Falkoff: APL   * Thomas E. Kurtz: BASIC   * Charles H. Moore: FORTH   * Robin Milner: ML   * Donald D. Chamberlin: SQL   * Alfred Aho, Peter Weinberger, and Brian Kernighan: AWK   * Charles Geschke and John Warnock: PostScript   * Bjarne Stroustrup: C++   * Bertrand Meyer: Eiffel   * Brad Cox and Tom Love: Objective-C   * Larry Wall: Perl   * Simon Peyton Jones, Paul Hudak, Philip Wadler, and John Hughes: Haskell   * Guido van Rossum: Python   * Luiz Henrique de Figueiredo and Roberto Ierusalimschy: Lua   * James Gosling: Java   * Grady Booch, Ivar Jacobson, and James Rumbaugh: UML   * Anders Hejlsberg: Delphi inventor and lead developer of C#   If you're interested in the people whose vision and hard work helped shape the computer industry, you'll find Masterminds of Programming fascinating.  

2010-12-26

gvim常用插件及其配置文件配置(下载解压即可使用)

gvim常用插件及其配置文件 支持c,perl,python,latex。 需要自己安装ctags .vim: after compiler doc indent ltags perl-support skeleton syntax autoload c-support ftdetect keymap Makefile plugin snipMate.vim.ct tools colors CVIMSYN ftplugin latextags Makefile.in README.csupport snippets .vim/after: ftplugin plugin syntax .vim/after/ftplugin: c_snippets.vim java_snippets.vim python_pydiction.vim python_snippets.vim sh_snippets.vim .vim/after/plugin: .vim/after/syntax: cpp.vim c.vim java.vim .vim/autoload: acp.vim perlsupportgui.vim perlsupportprofiling.vim perlsupportregex.vim snipMate.vim .vim/colors: desertEx.vim peachpuff.vim zenburn.vim .vim/compiler: tex.vim .vim/c-support: codesnippets doc rc scripts templates wordlists .vim/c-support/codesnippets: calloc_double_matrix.c main.cc print_array.cc.noindent calloc_int_matrix.c Makefile print_double_array.c.noindent main.c Makefile.multi-target.template print_int_array.c.noindent .vim/c-support/doc: ChangeLog c-hotkeys.pdf c-hotkeys.tex .vim/c-support/rc: customization.ctags customization.gvimrc customization.indent.pro customization.vimrc .vim/c-support/scripts: wrapper.sh .vim/c-support/templates: c.comments.template cpp.comments.template cpp.preprocessor.template c.statements.template c.cpp.template cpp.cpp.template cpp.statements.template Templates c.idioms.template cpp.idioms.template c.preprocessor.template Templates~ .vim/c-support/wordlists: c-c++-keywords.list c-c++-keywords.list.bak k+r.list stl_index.list .vim/CVIMSYN: engspchk.contraction engspchk.dialect engspchk.dict engspchk.match engspchk.proper engspchk.rare .vim/doc: acp.jax latexhelp.txt latex-suite-quickstart.css Makefile taglist.txt acp.txt latex-suite latex-suite-quickstart.html Makefile.in tags catalog.xml la

2010-08-17

Data Mining in Bioinformatics 生物信息中的数据挖掘

Jason T.L. Wang, Mohammed J. Zaki,Hannu T.T. Toivonen and Dennis Shasha (Eds) Summary The aim of this book is to introduce the reader to some of the best techniques for data mining in bioinformatics in the hope that the reader will build on them to make new discoveries on his or her own. The book contains twelve chapters in four parts, namely, overview, sequence and structure alignment, biological data mining, and biological data management.

2010-03-02

比perl好的生物信息学语言python

比perl好的生物信息学语言python,简明教程!

2009-09-26

空空如也

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