中立理論(ちゅうりつりろん)とは、生物地理学や生態学における理論の一つである。 一つのにおける生物の種多様性を取り扱うための一般理論として構想されたもので、生態群集の構造化が物理的要因や生物相互作用だけでなく個体群統計学的確率性によっても成立するという仮説に基づいている。生物多様性の中立説ともいう。