| dbo:abstract
|
- Illumina dye sequencing is a technique used to determine the series of base pairs in DNA, also known as DNA sequencing. The reversible terminated chemistry concept was invented by Bruno Canard and Simon Sarfati at the Pasteur Institute in Paris. It was developed by Shankar Balasubramanian and David Klenerman of Cambridge University, who subsequently founded Solexa, a company later acquired by Illumina. This sequencing method is based on reversible dye-terminators that enable the identification of single nucleotides as they are washed over DNA strands. It can also be used for whole-genome and region sequencing, transcriptome analysis, metagenomics, small RNA discovery, methylation profiling, and genome-wide protein-nucleic acid interaction analysis. (en)
- Метод Illumina/Solexa — метод секвенирования нового поколения, разработанный компанией Solexa. В основе метода лежит принцип секвенирования путём синтеза:
* Одноцепочечные фрагменты ДНК закрепляются на твердой подложке.
* ДНК-зависимая ДНК полимераза синтезирует комплементарную цепь.
* Встраивание каждого нового нуклеотида регистрируется с помощью камеры. В методе Solexa используются 3'- модифицированные нуклеотиды с присоединенными флюоресцентными метками разных цветов. Модификация нуклеотидов не позволяет ДНК-полимеразе присоединить больше одного нуклеотида. Флюоресценция инициируется коротким импульсом лазера и тип присоединенного нуклеотида определяется по цвету флюоресцентной метки. Модификация нуклеотида блокируется (полимераза теперь может двигаться дальше) и цикл повторяется снова. В результате удается определить последовательность ДНК длиной до 250 нуклеотидов. Такую последовательность ДНК называют прочтением или ридом — (калька с английского). Первый секвенатор Genome Analyzer 1G был представлен компанией Solexa в 2006 году. Длина прочтения составляла 30-35 нуклеотида, можно было получить около 1 Gb информации. HiSeq 2000 (2011 год) способен секвенировать 6 человеческих геномов за 11 дней. Длина прочтения составляет 100 нуклеотидов, можно получить 600 Gb информации. (ru)
|
| dbo:thumbnail
| |
| dbo:wikiPageID
| |
| dbo:wikiPageLength
|
- 16072 (xsd:nonNegativeInteger)
|
| dbo:wikiPageRevisionID
| |
| dbo:wikiPageWikiLink
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| dcterms:subject
| |
| gold:hypernym
| |
| rdf:type
| |
| rdfs:comment
|
- Illumina dye sequencing is a technique used to determine the series of base pairs in DNA, also known as DNA sequencing. The reversible terminated chemistry concept was invented by Bruno Canard and Simon Sarfati at the Pasteur Institute in Paris. It was developed by Shankar Balasubramanian and David Klenerman of Cambridge University, who subsequently founded Solexa, a company later acquired by Illumina. This sequencing method is based on reversible dye-terminators that enable the identification of single nucleotides as they are washed over DNA strands. It can also be used for whole-genome and region sequencing, transcriptome analysis, metagenomics, small RNA discovery, methylation profiling, and genome-wide protein-nucleic acid interaction analysis. (en)
- Метод Illumina/Solexa — метод секвенирования нового поколения, разработанный компанией Solexa. В основе метода лежит принцип секвенирования путём синтеза:
* Одноцепочечные фрагменты ДНК закрепляются на твердой подложке.
* ДНК-зависимая ДНК полимераза синтезирует комплементарную цепь.
* Встраивание каждого нового нуклеотида регистрируется с помощью камеры. (ru)
|
| rdfs:label
|
- Illumina dye sequencing (en)
- Метод Illumina/Solexa (ru)
|
| owl:sameAs
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| foaf:depiction
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is dbo:knownFor
of | |
| is dbo:wikiPageRedirects
of | |
| is dbo:wikiPageWikiLink
of | |
| is dbp:knownFor
of | |
| is rdfs:seeAlso
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
