Neuroinformatika

Informatika
	Obory informatiky;
	Programování;
	Matematická informatika (Teoretická informatika; Teorie složitosti; Umělá inteligence; Teorie grafů; Teorie informace);
	Informační technologie;
	Bioinformatika;
	Chemoinformatika;
	Geoinformatika;
	Lékařská informatika;
	Neuroinformatika;
	Sociální informatika;
	Informatici;
	Charles Babbage; Alan Turing; Donald Knuth; další…;
	Dějiny informatiky;

Neuroinformatika je vědní obor, zabývající se zpracováním a analýzou dat z oblasti neurověd za pomoci prostředků informatiky. Aplikací analytických a výpočetních metod jsou z dat získávány nové poznatky o funkci nervového systému, mechanizmech neurologických onemocnění atd.

Prolínání výzkumu v oblasti neurověd a informatiky je oboustranně přínosné, neboť jedné straně přináší nové - jinak obtížně získatelné - poznatky o fungování mozku, na straně druhé pak rozvoj a vývoj výpočetních metod pro analýzy a modelování.

Kromě samotné datové analýzy se neuroinformatika dále zabývá problematikou získávání, předzpracování a skladování dat, vytvářením datových úložišť a jejich integrací.

Typické úlohy Neuroinformatiky

Spike sorting

Jednou ze základních úloh neuroinformatiky je analýza aktivity nervových buněk (neuronů), zaznamenaná pomocí mikroelektrod. Takový záznam obsahuje součet aktivity (akčních potenciálů) několika neuronů v bezprostředním okolí elektrody a velké množství šumu. Cílem spike-sortingu je jednak odlišit v záznamu hodnotný signál od šumu a dále roztřídit aktivitu k jednotlivým neuronům. To se obvykle provádí na základě tvaru jednotlivých akčních potenciálů a výsledkem je pak série časových údajů, odpovídajících okamžikům aktivity (tzv. "pálení") jednotlivých neuronů.

Související obory

Jakožto mezioborová disciplína souvisí neuroinformatika s řadou oborů. Mezi jinými to jsou:

Vědecké časopisy

Neuroinformatics Cílem časopisu je podpora rozvoje a šíření výpočetních metod v oblasti výzkumu nervového systému
Frontiers in Neuroinformatics volně přístupný časopis, věnující se všem odvětvím Neuroinformatiky
Journal of Computational Neuroscience
Neural Computation
Journal of Integrative Neuroscience
Neuron

Neuroinformatika v České republice

Vědecké týmy a projekty

Výzkumu v oblasti neuroinformatiky se věnují následující pracoviště:

Katedra kybernetiky Fakulty elektrotechnické na ČVUT v Praze ^[1]
Ústav informatiky AV ČR^[2]

Neuroinformatika na českých vysokých školách

Studium neuroinformatiky zahrnují následující studijní programy:

Fakulta elektrotechnická ČVUT nabízí obor Biomedicínská informatika v rámci programu Biomedicínské inženýrství a informatika ^[3]
Fakulta aplikovaných věd ZČU nabízí obor Medicínská informatika Archivováno 17. 1. 2019 na Wayback Machine. v rámci programu Inženýrská informatika

Reference

↑ hluboké mozkové stimulace, Grant AV ČR, Informační systém výzkumu, experimentálního vývoje a inovací. www.isvav.cz [online]. [cit. 2011-01-19]. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2016-03-14.
↑ Neuroinformatika: výpočetní teorie neuronových sítí, Grant AV ČR, Informační systém výzkumu, experimentálního vývoje a inovací^{[nedostupný zdroj]}
↑ Biomedicína - Biomedicínské Inženýrství a Informatika na FEL ČVUT Praha. biomedicina.fel.cvut.cz [online]. [cit. 2011-01-19]. Dostupné v archivu pořízeném dne 2011-01-14.

Literatura

Neuroinformatics: An Overview of the Human Brain Project (Progress in Neuroinformatics Research Series) by Stephen H. Koslow and Michael F. Huerta,
Computing the Brain: A Guide to Neuroinformatics by Michael A. Arbib and Jeffrey S. Grethe,
Databasing the Brain: From Data to Knowledge (Neuroinformatics) by Steven H. Koslow and Shankar Subramaniam,
Brain Mapping: The Methods, Second Edition by Arthur W. Toga and John C. Mazziott,
Neuroscience Databases: A Practical Guide by Rolf Kötter,

Externí odkazy

Obrázky, zvuky či videa k tématu Neuroinformatika na Wikimedia Commons

[1] uboké mozkové stimulace, Grant AV ČR, Informační systém výzkumu, experimentálního vývoje a inovací. www.isvav.cz [online]. [cit. 2011-01-19]. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2016-03-14.

[2] Neuroinformatika: výpočetní teorie neuronových sítí, Grant AV ČR, Informační systém výzkumu, experimentálního vývoje a inovací^{[nedostupný zdroj]}

[3] Biomedicína - Biomedicínské Inženýrství a Informatika na FEL ČVUT Praha. biomedicina.fel.cvut.cz [online]. [cit. 2011-01-19]. Dostupné v archivu pořízeném dne 2011-01-14.

[1]

[2]

[3]