SeuratData安装得用devtools安装

Error:不存在叫“SeuratData”这个名字的程辑包。错误：安装“SeuratData”报错。这时包就可以成功加载了。

我今天在upenn的服务器的R环境上安装SeuratData包，但是发现出现一个问题，

环境Ubuntu22/20, R4.1。进入r语言交互环境，键入，

SeuratData 是一个使用 R 的内置包和数据管理系统以 Seurat 对象的形式分发数据集的机制。 它为用户提供了一种访问 Seurat vignettes 中使用的数据集的简便方法。 安装 SeuratData 的安装可以通过 devtools 完成。 devtools::install_github('satijalab/seurat-data') 入门 加载 SeuratData 时，将显示所有可用数据集的列表（这类似于 tidyverse 等其他元数据包以及用于创建每个数据集的 Seura

SeuratData：便捷的单细胞数据集管理与分发 SeuratData 是一个开源项目，旨在为单细胞分析工具 Seurat 提供便捷的数据集管理和分发机制。该项目主要使用 R 编程语言开发。 核心功能 SeuratData 的核心功能是允许用户轻松地安装、管理和加载用于 Seurat 教程和文档的数据集。它通过将数据集打包为 R 包的形式，使用户能够有选择性地安装和加载所需的数据集，从而节省存储...

SeuratData：开启单细胞数据分析的便捷之旅 项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/se/seurat-data 项目介绍 在单细胞基因表达分析的前沿阵地，SeuratData扮演着至关重要的角色。它是一个巧妙设计的机制，旨在通过R语言的内部包和数据管理系统分发以Seurat对象形式存在的数据集。由Satija实验室开发并维护，SeuratData让研究者能...

Seurat-Data 开源项目教程 项目介绍 Seurat-Data 是一个用于安装和管理 Seurat 数据集的 R 包。Seurat 是一个用于单细胞 RNA 测序数据分析的强大工具，而 Seurat-Data 则专注于提供各种单细胞数据集，这些数据集以 Seurat 对象的形式分布，并作为独立的包进行管理。通过 Seurat-Data，用户可以轻松地安装、管理和学习各种单细胞数据集。 项目...

尝试使用seurat包进行两组间差异分析 使用的是seurat包自带的数据 #首先载入需要的包 library(Seurat) #安装seurat-data包 install.packages('devtools') library("devtools") devtools::install_github('satijalab/seurat-data') library(SeuratData) library(patchwork) 安装数据集 # install dataset InstallData

Seurat-Data 项目使用教程 1. 项目的目录结构及介绍 Seurat-Data 项目的目录结构如下： seurat-data/ ├── DESCRIPTION ├── LICENSE ├── NAMESPACE ├── README.md ├── R/ │ ├── data.R │ ├── install.R │ ├── update.R │ └── utils.R ├─...

正确的安装代码是。

错误: No access to remote SeuratData repository, unable to install new datasets。

不管直接install,还是BiocManager都安装不上，每次都会这样报错。但是无论如何都是安装不上，报错都是一样的。并且我已经升级了g++(GCC)

本教程演示如何使用 Seurat (>=3.2) 分析空间分辨的 RNA-seq 数据。虽然分析流程类似于用于单细胞 RNA-seq 分析的 Seurat 工作流程，但我们引入了更新的交互和可视化工具，特别强调空间和分子信息的整合。本教程将涵盖以下任务，我们相信这些任务对于许多空间分析来说都是常见的：正常化降维和聚类检测空间变化的特征交互式可视化与单细胞 RNA-seq 数据整合使用多个切片。