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RSS订阅原创 在线生存分析（单因素、多因素、对比分组）
生存分析是研究事件发生时间的统计方法，能处理删失数据并分析影响因素。广泛应用于医学研究，如比较疗法效果或分析风险因素。核心概念包括事件、生存时间和删失数据。掌上生信绘图平台提供在线生存分析工具，支持一键分析并自动生成图表，无需编程，可修改参数重复分析。
2025-07-31 20:57:22
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原创 在线免疫浸润分析
免疫浸润分析是研究肿瘤微环境和免疫疾病的重要工具，用于量化样本中免疫细胞的组成、功能和分布。该分析可解析免疫微环境异质性，评估免疫治疗潜力，探索疾病机制，并开发预后生物标志物。掌上生信绘图平台提供在线分析工具，支持一键上传文件自动生成结果，无需编程，并可自由修改参数重新分析，所有任务独立记录便于查看。
2025-07-30 20:15:08
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原创 如何使用列线图快速评估风险、预后或诊断结果
摘要：列线图（Nomogram）是医学领域重要的多变量预测模型可视化工具，广泛应用于疾病风险预测（如癌症预后、心血管风险评估）、诊断辅助（肺结节良恶性鉴别）、治疗效果评估（血糖控制、移植排斥风险）及医患沟通。其优势在于整合多个临床参数实现直观预测，免除复杂计算。掌上生信绘图平台提供在线列线图分析服务，支持一键上传数据自动生成图表，并允许参数调整和任务管理，显著提升研究效率。该工具特别适合无编程基础的研究者快速获得可视化分析结果。
2025-07-29 20:38:01
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原创 如何利用机器学习分析筛选生物标记物
生物信息学中Lasso回归、随机森林和XGBoost在组学数据分析中应用广泛，包括癌症亚型分类、甲基化分析、GWAS增强等关键生物标志物筛选。这些方法无需编程基础，通过掌上生信绘图平台可一键完成分析并自动生成可视化结果，支持参数调整和任务管理，显著提升研究效率。
2025-07-28 20:57:00
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原创 xgboost 机器学习在生物信息学中的应用
XGBoost是一种高效的梯度提升决策树算法，广泛应用于生物信息学领域。该算法通过迭代训练多个决策树并组合优化，可用于疾病风险预测、基因突变分析、癌症分型、药物活性预测等12个关键应用场景。特别推荐"掌上生信绘图平台"（https://handybioplot.cn），无需编程即可实现一键分析，自动生成特征重要性排序图、ROC曲线等可视化结果，支持参数调整和任务管理，显著提升科研效率。
2025-07-27 09:00:00
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原创 随机森林分析在生物信息学中的应用
随机森林是一种集成学习算法，通过构建多棵决策树并结合投票或平均机制提高预测准确性。在生物信息学中，它广泛应用于疾病分类、突变预测、蛋白质互作分析、微生物研究、药物反应预测和细胞类型注释等领域。该算法能有效处理高通量组学数据，识别关键生物标志物。推荐使用掌上生信绘图平台进行在线分析，无需编程即可完成数据处理和可视化，支持参数调整和结果重现，显著提升研究效率。
2025-07-25 23:51:39
718
原创 Lasso 回归分析在生物信息学中的应用
Lasso回归是一种带L1正则化的线性回归方法，通过压缩不相关变量系数至0实现特征选择和防止过拟合。在生物信息学中广泛应用于生物标志物筛选（如癌症关键基因）、GWAS分析、多组学数据整合和药物反应预测（如癌症药物靶点）。推荐使用"掌上生信绘图平台"（handybioplot.cn）进行在线分析，该平台支持无代码操作，可一键生成Lasso图、lambda图和ROC图等，并提供参数调整和任务管理功能。
2025-07-24 21:03:21
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原创 如何选择数据降维分析方法
主流降维方法对比及在线分析平台推荐。PCA适合线性数据，PCoA适用于任意距离矩阵，t-SNE擅长局部结构可视化，UMAP平衡全局与局部结构，NMDS处理非度量数据。各方法在计算效率、数据结构保留和适用场景上各具特点。推荐使用"掌上生信绘图"在线平台（handybioplot.cn），支持一键分析并自动生成可视化结果，无需编程基础，可灵活调整参数重新分析，高效便捷。该平台能显著提升科研工作效率，节约时间成本。
2025-07-23 20:03:47
678
原创 在线 NMDS 降维分析
NMDS（非度量多维尺度分析）是一种降维可视化技术，用于将高维数据转换为2D/3D空间，保留样本间距离关系，适用于生态、基因等复杂数据。其优势包括不依赖数据分布假设、支持多种距离度量，并能识别关键影响因子。推荐使用"掌上生信绘图平台"进行在线一键分析，支持参数修改和结果比对，简化分析流程。该工具适合处理物种丰度、基因表达等含零值或非线性关系的数据，帮助研究者快速获取可视化结果。
2025-07-22 20:08:38
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原创 在线 tsne 降维分析
t-SNE是一种非线性降维技术，用于将高维数据可视化到2D/3D空间，保留局部结构和全局趋势，帮助发现聚类模式。与PCA不同，t-SNE更关注邻近样本关系，适合揭示非线性结构和精细亚群。推荐使用"掌上生信绘图平台"进行一键分析，支持参数修改和任务管理，简化分析流程。该平台无需编程，可快速生成可视化结果并识别数据特征。
2025-07-21 21:14:18
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原创 在线 UMAP 降维分析
UMAP是一种高效的非线性降维算法，适用于单细胞RNA-seq等大数据可视化，能同时保留数据的局部和全局结构。相比t-SNE计算更快，可处理百万级样本，并支持整合标签信息增强分类效果。推荐使用掌上生信绘图平台（https://handybioplot.cn）进行一键分析，无需编程即可生成UMAP图，支持参数调整和任务管理，提高科研效率。
2025-07-18 23:36:53
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原创 在线 PCoA 降维分析
PCoA（主坐标分析）是一种基于距离矩阵的降维方法，可将样本间复杂关系转换为可视化坐标，揭示数据隐藏结构。相比PCA，PCoA支持任意距离度量（如Bray-Curtis），特别适合处理物种丰度等非线性数据。分析目的包括：可视化样本相似性/差异性、识别关键驱动因素、数据探索与质量控制。推荐使用"掌上生信绘图平台"进行在线分析，无需编程即可一键生成PCoA图，并支持参数修改和任务管理，为用户提供便捷的分析体验。
2025-07-17 20:42:56
269
原创 在线 PCA 降维分析
主成分分析（PCA）是一种常用的数据降维技术，通过提取数据中的主要变异信息，将高维数据简化为低维表示。其核心应用包括数据可视化、关键变量识别、噪声去除和标准化处理。PCA可生成2D/3D散点图展示样本分布，发现差异驱动因素，并提高后续分析效率。对于不熟悉编程的用户，推荐使用"掌上生信绘图平台"，无需代码即可一键完成PCA分析并可视化。该平台支持参数调整和结果重新计算，满足不同分析需求。
2025-07-16 20:19:21
530
原创 非模式生物富集分析
摘要：GO/KEGG/GSEA是常见的生物信息学富集分析方法。GO分析基因功能（分子功能、细胞组分、生物学过程）；KEGG分析基因在代谢、信号通路等中的作用；GSEA通过基因集评估表达变化趋势。这些方法依赖包含基因列表的数据库，模式生物有现成数据库（如clusterProfile::org.db），非模式生物需自建。推荐"掌上生信绘图平台"（https://handybioplot.cn），支持19个物种的一键分析，可自定义参数和重新提交任务，结果可视化并记录。
2025-07-15 20:32:37
1039
原创 在线 GSEA 富集分析
GSEA是一种无需预设阈值的高通量基因分析方法，通过检测基因集的协同变化来识别功能通路，克服了传统差异基因分析的局限性。该方法适用于多组学数据，能发现微弱但一致的生物学信号。对于非编程用户，可借助掌上生信绘图平台实现一键化分析，该平台支持参数调整和多任务管理，简化了GSEA的分析流程。
2025-07-14 20:07:18
866
原创 在线 Reactome 富集分析
Reactome富集分析是一种基于Reactome通路数据库的生物信息学方法，用于研究基因或蛋白质集合在生物学通路中的功能富集。Reactome是一个高质量人工注释的数据库，涵盖代谢、信号传导等生物学过程。该方法可解析基因功能、揭示疾病机制、支持多组学数据整合并指导实验验证。对于不熟悉代码的研究者，可使用掌上生信绘图平台一键分析并自动生成可视化结果，该平台提供参数修改和任务管理功能，方便反复优化分析结果。
2025-07-13 13:52:30
559
原创 在线 DO 富集分析
DO富集分析是一种基于疾病本体的生物信息学方法，用于识别基因集与疾病的关联性。该方法通过分析差异表达基因或GWAS关联基因，揭示疾病分子机制、发现治疗靶点，并支持跨疾病比较。分析结果可呈现为柱状图、气泡图等形式，用户可通过"掌上生信绘图平台"进行一键分析，并灵活调整绘图参数。该工具为研究者提供了高效便捷的疾病关联分析解决方案，支持多次参数优化和结果对比。
2025-07-12 12:37:39
213
原创 在线 KEGG 富集分析
KEGG富集分析（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes Enrichment Analysis）是一种基于KEGG通路数据库的生物信息学方法，用于研究与特定基因集（如差异表达基因、突变基因）相关的代谢通路或信号通路的富集情况，其核心目标是揭示基因在生物学通路中的功能关联，帮助研究者理解基因集合的潜在生物学机制。#掌上生信绘图 #handybioplot #生信 #生物 #科研 #医学 #可视化 #绘图 #R语言 #python #富集分析 #气泡图。
2025-07-10 20:32:07
418
原创 在线 GO 富集分析
GO富集分析是解读基因功能的重要生物信息学方法，通过检测基因集合中GO术语的富集程度，揭示基因在生物学过程、分子功能及细胞组分中的潜在作用。该方法能帮助研究者理解基因功能、发现关键生物学环节、简化复杂数据并指导后续实验。对于非编程用户，推荐使用"掌上生信绘图平台"(https://handybioplot.cn)，只需上传数据即可自动完成分析并生成可自定义的图表（如柱状图、气泡图），所有分析任务独立保存且支持参数调整重新分析。
2025-07-09 20:47:28
720
原创 在线差异表达分析
摘要：差异表达分析用于比较不同生物学条件下的基因表达差异，以识别关键基因并解释其功能意义。若缺乏代码条件，可使用"掌上生信绘图平台"直接上传数据，自动完成差异分析并生成可视化图表（如火山图、柱状图）。该平台支持参数调整和任务回溯，便于优化分析结果。（98字）
2025-07-07 20:49:09
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原创 掌上生信绘图：在线生信分析与绘图平台
《掌上生信绘图平台：一站式生物信息分析工具》摘要 HandyBioPlot是一个集成80多种生信分析工具的在线平台，支持差异表达分析、富集分析等专业分析，并提供科研级绘图功能。平台特色包括：灵活的参数调整、独立任务记录（有效期1周）、可视化参数修改和AI智能对话等辅助工具。用户可实时查看分析日志，通过任务列表管理多轮分析，并能提交反馈优化平台功能。该平台旨在简化生信分析流程，帮助科研人员高效完成从数据到发表级图表的全流程工作。
2025-07-06 14:20:45
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