【完整源码+数据集+部署教程】细胞类型识别系统源码和数据集：改进yolo11-KernelWarehouse

背景意义

研究背景与意义

细胞类型的识别在医学诊断、疾病监测和生物研究中具有重要意义。随着计算机视觉技术的快速发展，基于深度学习的图像识别方法逐渐成为细胞分类的主流手段。YOLO（You Only Look Once）系列模型因其高效的实时检测能力和较高的准确性，广泛应用于各种视觉任务。尤其是YOLOv11作为该系列的最新版本，凭借其改进的网络结构和算法，能够更好地处理复杂的图像特征，提升细胞类型识别的精度和速度。

在细胞病理学中，准确识别不同类型的细胞对于早期诊断和治疗方案的制定至关重要。通过对细胞进行分类，可以帮助医生更好地理解病变的性质，从而制定个性化的治疗方案。本研究将基于改进的YOLOv11模型，开发一个细胞类型识别系统，旨在提高对五种特定细胞类型（如Dyskeratotic、Koilocytotic、Metaplastic、Parabasal和Superficial-Intermediate）的识别能力。

本项目所使用的数据集包含1700幅经过精细标注的细胞图像，涵盖了多种细胞类型。数据集的多样性和丰富性为模型的训练提供了良好的基础。通过对数据集的有效利用，结合YOLOv11的强大功能，我们期望能够显著提升细胞识别的准确率，并在此基础上为相关领域的研究提供新的思路和方法。

此外，随着医学影像数据的不断增加，如何高效、准确地处理和分析这些数据成为一个亟待解决的问题。本研究不仅具有重要的理论价值，也为实际应用提供了有力的支持。通过构建一个高效的细胞类型识别系统，我们希望能够推动细胞生物学和医学影像分析领域的发展，为未来的研究和临床应用奠定基础。

图片效果

数据集信息

本项目数据集信息介绍

本项目所使用的数据集旨在为改进YOLOv11的细胞类型识别系统提供坚实的基础。该数据集围绕“many_toget”主题构建，专注于细胞类型的分类与识别，涵盖了五种不同的细胞类别。这些类别分别为：Dyskeratotic（角化不良细胞）、Koilocytotic（空泡细胞）、Metaplastic（化生细胞）、Parabasal（基底细胞）和Superficial-Intermediate（表层-中间细胞）。每一种细胞类型在临床病理学中具有重要的诊断意义，因此准确的识别和分类对于疾病的早期发现和治疗至关重要。

数据集的构建过程遵循严格的标准，确保每一类细胞样本的代表性和多样性。样本来源于多种临床样本和实验室切片，经过精细的标注和分类，确保每个细胞图像都能准确反映其对应的类别特征。这种多样化的样本收集策略不仅提高了模型的泛化能力，也增强了其在不同条件下的识别准确性。

在数据集的标注过程中，采用了先进的图像处理技术，以确保细胞特征的清晰可辨。每个细胞图像都经过专业的病理学家审核，确保标注的准确性和一致性。这种高质量的数据集为YOLOv11模型的训练提供了丰富的学习材料，使其能够更好地理解和识别不同类型的细胞。

通过对这些细胞类型的深入学习，改进后的YOLOv11系统将能够在临床应用中实现更高效的细胞识别和分类，为病理诊断提供有力支持。最终目标是提升细胞识别的准确性和效率，推动医学影像分析领域的发展。

核心代码

以下是简化后的核心代码部分，并附上详细的中文注释：

import torch
import torch.nn as nn
import torch.nn.functional as F
from timm.layers import weight_init

定义激活函数类
class Activation(nn.ReLU):
def init(self, dim, act_num=3, deploy=False):
super(Activation, self).init()
self.deploy = deploy
# 初始化权重和偏置
self.weight = torch.nn.Parameter(torch.randn(dim, 1, act_num2 + 1, act_num2 + 1))
self.bn = nn.BatchNorm2d(dim, eps=1e-6) # 批归一化
weight_init.trunc_normal_(self.weight, std=.02) # 权重初始化

def forward(self, x):
    # 前向传播
    if self.deploy:
        return F.conv2d(
            super(Activation, self).forward(x), 
            self.weight, None, padding=(self.act_num*2 + 1)//2, groups=self.dim)
    else:
        return self.bn(F.conv2d(
            super(Activation, self).forward(x),
            self.weight, padding=self.act_num, groups=self.dim))

def switch_to_deploy(self):
    # 切换到部署模式，融合批归一化
    if not self.deploy:
        kernel, bias = self._fuse_bn_tensor(self.weight, self.bn)
        self.weight.data = kernel
        self.bias = torch.nn.Parameter(torch.zeros(self.dim))
        self.bias.data = bias
        self.__delattr__('bn')  # 删除bn属性
        self.deploy = True

def _fuse_bn_tensor(self, weight, bn):
    # 融合权重和批归一化
    running_mean = bn.running_mean
    running_var = bn.running_var
    gamma = bn.weight
    beta = bn.bias
    eps = bn.eps
    std = (running_var + eps).sqrt()
    t = (gamma / std).reshape(-1, 1, 1, 1)
    return weight * t, beta - running_mean * gamma / std

定义基本块
class Block(nn.Module):
def init(self, dim, dim_out, act_num=3, stride=2, deploy=False):
super().init()
self.deploy = deploy
# 根据是否部署选择不同的卷积结构
if self.deploy:
self.conv = nn.Conv2d(dim, dim_out, kernel_size=1)
else:
self.conv1 = nn.Sequential(
nn.Conv2d(dim, dim, kernel_size=1),
nn.BatchNorm2d(dim, eps=1e-6),
)
self.conv2 = nn.Sequential(
nn.Conv2d(dim, dim_out, kernel_size=1),
nn.BatchNorm2d(dim_out, eps=1e-6)
)
self.pool = nn.MaxPool2d(stride) if stride != 1 else nn.Identity() # 池化层
self.act = Activation(dim_out, act_num) # 激活函数

def forward(self, x):
    # 前向传播
    if self.deploy:
        x = self.conv(x)
    else:
        x = self.conv1(x)
        x = F.leaky_relu(x, negative_slope=0.1)  # 使用Leaky ReLU激活
        x = self.conv2(x)

    x = self.pool(x)  # 池化
    x = self.act(x)  # 激活
    return x

def switch_to_deploy(self):
    # 切换到部署模式，融合卷积和批归一化
    if not self.deploy:
        kernel, bias = self._fuse_bn_tensor(self.conv1[0], self.conv1[1])
        self.conv1[0].weight.data = kernel
        self.conv1[0].bias.data = bias
        kernel, bias = self._fuse_bn_tensor(self.conv2[0], self.conv2[1])
        self.conv = self.conv2[0]
        self.conv.weight.data = kernel
        self.conv.bias.data = bias
        self.__delattr__('conv1')
        self.__delattr__('conv2')
        self.act.switch_to_deploy()
        self.deploy = True

定义VanillaNet模型

class VanillaNet(nn.Module):
def init(self, in_chans=3, num_classes=1000, dims=[96, 192, 384, 768], strides=[2,2,2,1], deploy=False):
super().init()
self.deploy = deploy
# 定义输入层
if self.deploy:
self.stem = nn.Sequential(
nn.Conv2d(in_chans, dims[0], kernel_size=4, stride=4),
Activation(dims[0])
)
else:
self.stem1 = nn.Sequential(
nn.Conv2d(in_chans, dims[0], kernel_size=4, stride=4),
nn.BatchNorm2d(dims[0], eps=1e-6),
)
self.stem2 = nn.Sequential(
nn.Conv2d(dims[0], dims[0], kernel_size=1, stride=1),
nn.BatchNorm2d(dims[0], eps=1e-6),
Activation(dims[0])
)

    self.stages = nn.ModuleList()
    for i in range(len(strides)):
        stage = Block(dim=dims[i], dim_out=dims[i+1], stride=strides[i], deploy=deploy)
        self.stages.append(stage)

def forward(self, x):
    # 前向传播
    if self.deploy:
        x = self.stem(x)
    else:
        x = self.stem1(x)
        x = F.leaky_relu(x, negative_slope=0.1)
        x = self.stem2(x)

    for stage in self.stages:
        x = stage(x)  # 通过每个Block
    return x

def switch_to_deploy(self):
    # 切换到部署模式
    if not self.deploy:
        self.stem2[2].switch_to_deploy()
        kernel, bias = self._fuse_bn_tensor(self.stem1[0], self.stem1[1])
        self.stem1[0].weight.data = kernel
        self.stem1[0].bias.data = bias
        self.stem = nn.Sequential(self.stem1[0], self.stem2[2])
        self.__delattr__('stem1')
        self.__delattr__('stem2')

        for stage in self.stages:
            stage.switch_to_deploy()

        self.deploy = True

测试模型
if name == ‘main’:
inputs = torch.randn((1, 3, 640, 640)) # 随机输入
model = VanillaNet(dims=[1284, 2564, 5124, 10244]) # 创建模型
pred = model(inputs) # 前向传播
for i in pred:
print(i.size()) # 输出每层的尺寸
代码注释说明：
Activation类：自定义的激活函数类，继承自nn.ReLU，支持在训练和部署模式下的不同处理。
Block类：定义了一个基本的卷积块，包含卷积层、批归一化和激活函数。根据deploy标志决定使用不同的结构。
VanillaNet类：主模型类，包含输入层和多个Block。支持在训练和部署模式下的不同处理。
switch_to_deploy方法：用于切换到部署模式，融合批归一化层以提高推理效率。
主函数：用于测试模型的前向传播，输出每层的尺寸。
这个程序文件名为 VanillaNet.py，主要实现了一个名为 VanillaNet 的深度学习模型，适用于图像处理任务。该模型的设计灵感来源于现代卷积神经网络（CNN），并结合了一些新的技术和结构以提高性能。

文件开头包含版权信息和许可证声明，说明该程序是开源的，可以在 MIT 许可证下使用和修改。接下来，程序导入了必要的库，包括 PyTorch 和一些自定义的模块。

在代码中，定义了多个类和函数。首先是 activation 类，它继承自 nn.ReLU，用于实现自定义的激活函数。这个类包含了可学习的权重和偏置，并在前向传播中应用卷积操作。该类还实现了批归一化（Batch Normalization）和权重融合的方法，以便在模型部署时优化性能。

接着是 Block 类，它是 VanillaNet 的基本构建块。每个 Block 包含多个卷积层和激活函数，支持不同的步幅和可选的自适应池化。Block 类同样实现了权重融合和切换到部署模式的方法，以提高推理效率。

VanillaNet 类是整个模型的核心。它初始化了模型的结构，包括输入通道、类别数、各层的维度、丢弃率等参数。模型的前向传播过程包括通过多个 Block 进行特征提取，并在每个阶段根据输入大小记录特征图。该类还实现了权重初始化和激活函数的调整方法。

在文件的后半部分，定义了一些函数（如 update_weight 和多个 vanillanet_x 函数），用于创建不同配置的 VanillaNet 模型，并支持加载预训练权重。这些函数允许用户根据需要选择不同的模型架构和参数设置。

最后，文件中有一个主程序块，创建了一个随机输入并实例化了 vanillanet_10 模型，随后进行前向传播并打印输出特征图的尺寸。这部分代码可以用于快速测试模型的基本功能。

总体来说，这个程序实现了一个灵活且高效的卷积神经网络架构，适合用于各种计算机视觉任务，并提供了多种配置选项以满足不同的需求。

10.4 metaformer.py
以下是保留的核心代码部分，并附上详细的中文注释：

import torch
import torch.nn as nn
import torch.nn.functional as F

class MF_Attention(nn.Module):
“”"
自注意力机制的实现，参考Transformer论文。
“”"
def init(self, dim, head_dim=32, num_heads=None, qkv_bias=False,
attn_drop=0., proj_drop=0., proj_bias=False):
super().init()

    # 设置头部维度和缩放因子
    self.head_dim = head_dim
    self.scale = head_dim ** -0.5

    # 计算头的数量
    self.num_heads = num_heads if num_heads else dim // head_dim
    if self.num_heads == 0:
        self.num_heads = 1
    
    # 计算注意力的维度
    self.attention_dim = self.num_heads * self.head_dim

    # 定义线性层用于计算Q、K、V
    self.qkv = nn.Linear(dim, self.attention_dim * 3, bias=qkv_bias)
    self.attn_drop = nn.Dropout(attn_drop)  # 注意力的dropout
    self.proj = nn.Linear(self.attention_dim, dim, bias=proj_bias)  # 投影层
    self.proj_drop = nn.Dropout(proj_drop)  # 投影后的dropout

def forward(self, x):
    B, H, W, C = x.shape  # 获取输入的批次大小、高度、宽度和通道数
    N = H * W  # 计算总的token数量
    # 计算Q、K、V并进行重塑
    qkv = self.qkv(x).reshape(B, N, 3, self.num_heads, self.head_dim).permute(2, 0, 3, 1, 4)
    q, k, v = qkv.unbind(0)  # 分离Q、K、V

    # 计算注意力权重
    attn = (q @ k.transpose(-2, -1)) * self.scale  # 点积注意力
    attn = attn.softmax(dim=-1)  # 归一化
    attn = self.attn_drop(attn)  # 应用dropout

    # 计算输出
    x = (attn @ v).transpose(1, 2).reshape(B, H, W, self.attention_dim)  # 加权求和
    x = self.proj(x)  # 投影到原始维度
    x = self.proj_drop(x)  # 应用dropout
    return x  # 返回结果

class Mlp(nn.Module):
“”"
多层感知机（MLP）模块，常用于MetaFormer模型。
“”"
def init(self, dim, mlp_ratio=4, out_features=None, act_layer=nn.GELU, drop=0., bias=False):
super().init()
in_features = dim
out_features = out_features or in_features
hidden_features = int(mlp_ratio * in_features) # 隐藏层特征数
drop_probs = (drop, drop) # dropout概率

    # 定义两层线性变换
    self.fc1 = nn.Linear(in_features, hidden_features, bias=bias)
    self.act = act_layer()  # 激活函数
    self.drop1 = nn.Dropout(drop_probs[0])  # 第一层的dropout
    self.fc2 = nn.Linear(hidden_features, out_features, bias=bias)
    self.drop2 = nn.Dropout(drop_probs[1])  # 第二层的dropout

def forward(self, x):
    x = self.fc1(x)  # 第一层线性变换
    x = self.act(x)  # 激活
    x = self.drop1(x)  # 应用dropout
    x = self.fc2(x)  # 第二层线性变换
    x = self.drop2(x)  # 应用dropout
    return x  # 返回结果

class MetaFormerBlock(nn.Module):
“”"
MetaFormer块的实现。
“”"
def init(self, dim,
token_mixer=nn.Identity, mlp=Mlp,
norm_layer=nn.LayerNorm,
drop=0., drop_path=0.,
layer_scale_init_value=None, res_scale_init_value=None):

    super().__init__()

    self.norm1 = norm_layer(dim)  # 第一层归一化
    self.token_mixer = token_mixer(dim=dim, drop=drop)  # token混合器
    self.drop_path1 = nn.Dropout(drop_path) if drop_path > 0. else nn.Identity()  # 路径dropout
    self.layer_scale1 = nn.Parameter(torch.ones(dim)) if layer_scale_init_value else nn.Identity()  # 层缩放
    self.res_scale1 = nn.Parameter(torch.ones(dim)) if res_scale_init_value else nn.Identity()  # 残差缩放

    self.norm2 = norm_layer(dim)  # 第二层归一化
    self.mlp = mlp(dim=dim, drop=drop)  # MLP模块
    self.drop_path2 = nn.Dropout(drop_path) if drop_path > 0. else nn.Identity()  # 路径dropout
    self.layer_scale2 = nn.Parameter(torch.ones(dim)) if layer_scale_init_value else nn.Identity()  # 层缩放
    self.res_scale2 = nn.Parameter(torch.ones(dim)) if res_scale_init_value else nn.Identity()  # 残差缩放

def forward(self, x):
    x = self.norm1(x)  # 归一化
    x = self.token_mixer(x)  # token混合
    x = self.drop_path1(x)  # 应用dropout
    x = self.layer_scale1(x) + x  # 残差连接

    x = self.norm2(x)  # 归一化
    x = self.mlp(x)  # MLP处理
    x = self.drop_path2(x)  # 应用dropout
    x = self.layer_scale2(x) + x  # 残差连接
    return x  # 返回结果

代码说明
MF_Attention: 实现了自注意力机制，主要包括计算Q、K、V，计算注意力权重，并将其应用于值V上，最后通过线性层投影回原始维度。

Mlp: 实现了一个简单的多层感知机，包含两层线性变换和激活函数，支持dropout。

MetaFormerBlock: 实现了MetaFormer的基本块，包含归一化、token混合、MLP和残差连接。通过层缩放和路径dropout增强模型的稳定性和性能。

这个程序文件 metaformer.py 实现了一些用于构建 MetaFormer 模型的基础组件。MetaFormer 是一种新型的深度学习架构，主要用于图像处理和计算机视觉任务。文件中定义了多个类，每个类都实现了特定的功能，以下是对这些类的逐一说明。

首先，Scale 类用于对输入向量进行元素级别的缩放。它通过一个可训练的参数 scale 来实现，允许在训练过程中调整缩放因子。

接下来，SquaredReLU 和 StarReLU 类实现了不同的激活函数。SquaredReLU 是对 ReLU 激活函数的平方形式，而 StarReLU 则在 ReLU 的基础上增加了可学习的缩放和偏置参数。

MF_Attention 类实现了经典的自注意力机制，源自 Transformer 模型。它通过线性变换生成查询、键和值，并计算注意力权重，最后通过线性投影输出结果。

RandomMixing 类用于对输入进行随机混合，生成一个随机矩阵并应用于输入特征。这种操作可以用于增强模型的鲁棒性。

LayerNormGeneral 类实现了一种通用的层归一化，允许用户自定义归一化的维度和是否使用缩放与偏置。LayerNormWithoutBias 是一个优化版本，直接使用 PyTorch 的 F.layer_norm 函数来实现层归一化，但不使用偏置。

SepConv 类实现了分离卷积，源自 MobileNetV2 的设计。它首先通过一个线性层进行逐点卷积，然后进行深度卷积，最后再通过另一个线性层输出结果。

Pooling 类实现了一种池化操作，主要用于 PoolFormer 模型。它通过平均池化来减小特征图的尺寸，并将结果与原始输入相减。

Mlp 类实现了多层感知机（MLP），通常用于 MetaFormer 模型中。它包含两个线性层和一个激活函数，支持 dropout 操作。

ConvolutionalGLU 类实现了一种卷积门控线性单元（GLU），结合了卷积和激活函数的特性，用于提取特征。

MetaFormerBlock 和 MetaFormerCGLUBlock 类分别实现了 MetaFormer 的基本模块。这些模块结合了归一化、令牌混合、MLP 和残差连接等机制，形成了深度网络的基本构建块。

整体而言，这个文件提供了构建 MetaFormer 模型所需的基础组件，支持灵活的设计和多种变体，适用于各种计算机视觉任务。

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