Esse mês comemoramos 15 anos do lançamento da rede
speciesLink e aproveitamos a data para documentar um pouco da sua história.
Em 1999, com o lançamento oficial do programa
Biota/Fapesp no estado de São Paulo, teve início o desenvolvimento do sistema de informação ambiental do programa, o
SinBiota. Esse sistema tinha por objetivo documentar as coletas feitas pelos diversos projetos do programa integradas a uma base cartográfica, e foi desenvolvido pelo CRIA em colaboração com o Instituto Florestal, o Instituto de Computação e o Instituto de Geociências da Unicamp. O primeiro Atlas do
SinBiota foi lançado em dezembro de 2000, integrando os dados dos mais de 20 projetos temáticos.
O desenvolvimento do segundo sistema de informação para o programa teve início em 2001 com o projeto "
Sistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas: a Integração do Species Analyst e do SinBiota" ou
speciesLink. O objetivo era criar um sistema distribuído de informação sobre espécies e espécimes mantidos em coleções biológicas do estado de São Paulo, associado a um sistema de previsão de distribuição geográfica de espécies, baseado em modelagem matemática.
Os grandes desafios incluíam:
- a promoção de uma mudança cultural visando o compartilhamento aberto dos dados a qualquer pessoa interessada na Internet;
- a organização e digitação dos acervos das coleções biológicas (fauna, flora, microbiota) do país e do exterior;
- a necessidade de listas com nomes aceitos e sinonímia da fauna, flora, microbiota e fungos do Brasil;
- o desenvolvimento de padrões e protocolos para garantir a interoperabilidade dos sistemas;
- o desenvolvimento de uma interface de busca eficiente; e,
- o desenvolvimento de uma arquitetura distribuída que:
- não fosse impactada pela entrada de novos provedores na rede;
- trabalhasse com um modelo de dados padrão, sem interferir na escolha do software utilizado pela coleção para gerenciar seus dados;
- mantivesse no provedor original o controle e a política de compartilhamento de seus dados.
O sistema on-line foi lançado há 15 anos, em outubro de 2002, com dados do Herbário da Unicamp (
UEC), da Coleção de Algas (
SPF-Algae) do Instituto de Botânica da USP, da Coleção de Ácaros (
AcariESALQ) da ESALQ e das Coleções de Peixes da Unesp de São José do Rio Preto (
DZSJRP-Pisces) e da USP Ribeirão Preto (
LIRP). O apoio da Fapesp ao desenvolvimento específico da rede speciesLink terminou em outubro de 2005 com 40 provedores de dados e pouco mais de 700 mil registros on-line. Neste mesmo ano, o sistema já contava com alguns indicadores que mostravam a evolução da rede.
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| Distribuição geográfica dos provedores de dados em 2005 |
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Na sequência do projeto
speciesLink, a Fapesp apoiou o desenvolvimento do
openModeller (outubro de 2005 a outubro de 2008), um ambiente computacional para a geração de modelos de distribuição potencial de espécies (
openmodeller.sourceforge.net). Além do CRIA, o desenvolvimento do openModeller contou com a parceria do INPE – Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais e da Escola Politécnica da USP. No âmbito do projeto também foram desenvolvidos vários aplicativos visando auxiliar o trabalho dos curadores na limpeza de seus dados, resultando no
relatório dataCleaning. Nesse período, o CRIA também contou com recursos do GBIF (rede de polinizadores, desenvolvimento de ferramentas) e da JRS Foundation.
Em 2006 foi dado início às ações de repatriação de dados de amostras coletadas no Brasil e depositadas nos Jardins Botânicos de Nova Iorque e Missouri. São hoje cerca de 1,5 milhão de registros que representam cerca de 15% dos dados disponíveis na rede
speciesLink. A repatriação é fundamental, sendo fonte importante de dados de coletas realizadas nos séculos passados.
Em 2006, por solicitação do Ministério de Ciência e Tecnologia foi publicado o trabalho “
Diretrizes e estratégias para a modernização de coleções biológicas brasileiras e a consolidação de sistemas integrados de informação sobre biodiversidade”. Esse trabalho contou com a parceria das Sociedades Brasileiras de Botânica, Zoologia, Microbiologia, da Informação e membros do CRIA, do CGEE e da Secretaria de Política e Programas de Pesquisa e Desenvolvimento do MCT. Esse fato foi importante não só pela estratégia estabelecida, mas pelo processo de discussão que aproximou a comunidade de coleções biológicas com o CRIA e a
Rede Nacional de Ensino e Pesquisa, RNP. O CRIA, inclusive, adotou o documento como parte do seu plano estratégico.
Em 2008, a rede
SiCol - Sistema de Informação de Coleções de Interesse Biotecnológico foi integrada à rede
speciesLink. Com a evolução dos dados da fauna, flora, fungos e da microbiota, 2008 fechou o ano com 150 conjuntos de dados compartilhando cerca de 2,9 milhões de registros. Além dos dados de amostras brasileiras nos Jardins Botânicos de Missouri e Nova Iorque, foram repatriados dados do Museum of Vertebrate Zoology da Universidade da Califórnia, Berkeley. Também foram incorporados os dados sobre a biodiversidade da Amazônia Colombiana da Fundación Puerto Rastrojo.
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| Distribuição geográfica dos provedores de dados em 2008 |
Em 2009 teve início o
Herbário Virtual da Flora e dosFungos, um dos Institutos Nacionais de Ciência e Tecnologia do país. Esse
projeto foi um divisor de águas. Foi a partir do INCT-Herbário Virtual que a
infraestrutura de dados e ferramentas passou a ser um componente de uma verdadeira
rede de pessoas, instituições e sistemas. Passamos – equipe de desenvolvimento,
suporte e manutenção do CRIA – a fazer parte de uma grande rede social, que
inclui curadores, técnicos, pesquisadores, especialistas em redes (Internet) e
usuários, do país e do exterior. A RNP dá suporte ao CRIA, com o acesso à
Internet e com a hospedagem dos equipamentos no seu
Internet Data Center. O
CRIA dá suporte às coleções biológicas na organização e integração de seus
dados à rede. As coleções dão suporte aos pesquisadores e alunos, no depósito e
registro de novos espécimes. Os pesquisadores, alunos e demais usuários dão
suporte a todo o sistema, enviando seus comentários, desenvolvendo modelos e
identificando espécies e locais prioritários para coletas.
A rede hoje integra 470 conjuntos de dados: 235 de animais;
195 de algas, fungos e plantas; 3 de fósseis; 34 de microrganismos e 3 de
coleções abrangentes (Fonte:
Rede speciesLink). Dos 470 conjuntos de dados, 429 são do Brasil e 41 são de
dados coletados no Brasil e mantidos em instituições do exterior. São dados de
coleções biológicas de 143 instituições do país e 33 do exterior, além de 4
fototecas mantidas por pesquisadores brasileiros. Das 143 instituições
brasileiras, contando diferentes campi como instituição, 100 são universidades
e o restante instituições de pesquisa. São 52 universidades federais, 8
regionais, 31 estaduais e 9 privadas.
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| Distribuição geográfica dos provedores de dados em outubro de 2017 |
Graças aos desenvolvimentos realizados no contexto do
INCT-Herbário Virtual, a
interface de busca, além da recuperação de dados
textuais, oferece ferramentas para a visualização dos dados em mapas, gráficos,
listas, planilhas, resumos, estatísticas, além de aplicativos para
visualização, análise e comparação de imagens. A rede também disponibiliza uma
série de
indicadores e
ferramentas de
análise de lacunas de dados e conhecimento e de
distribuição geográfica de espécies. São compartilhados cerca
de 8,8 milhões de registros de cerca de 124 mil espécies aceitas distintas e
1,8 milhão de imagens.
Em outubro de 2017 o
uso dos dados através da interface de
busca já supera os valores de 2016. Já foram utilizados mais de 600 milhões de
registros, o que representa uma média de 2 milhões de registros utilizados por
dia. Nesse período também foram servidas mais de 2,5 milhões de imagens, cerca
de 9 mil imagens visualizadas por dia.
A rede speciesLink
também alimenta o GBIF, SiBBr e iDigBio com cerca de 4,2 milhões de registros
de 158 provedores. O uso desses dados servidos através dessas plataformas não é
computado nas nossas estatísticas. Também não dispomos de dados sobre o
uso das imagens pela Flora do Brasil 2020.
Ao longo de todos estes anos, mesmo com o apoio financeiro
recebido através de projetos e a colaboração de todas as pessoas e instituições
que participam da rede, não foram poucos os desafios e as dificuldades. Um
sistema deste porte requer financiamento contínuo para renovação do hardware,
aprimoramento do software, e suporte técnico, sempre através de uma equipe
compatível com o trabalho a ser realizado (no CRIA, nos herbários, nos museus,
nas coleções biológicas em geral e na RNP), além de verbas para pesquisa,
bolsas, etc. (para uma discussão mais aprofundada, sugerimos a leitura do
artigo “
The Importance of Biodiversity E-infrastructures for Megadiverse Countries”). Para que a rede consiga dar
os próximos passos em direção ao futuro, é preciso que haja compreensão quanto
ao grau de investimento necessário para manutenção e expansão do sistema, bem
como reconhecimento de que sua importância para a sociedade transcende os
interesses políticos de algumas instituições e questões pessoais. O CRIA
sente-se privilegiado em ter dado a sua contribuição para a construção de um
sistema dessa magnitude e continuará trabalhando para que seu futuro seja ainda
melhor.
Equipe do CRIA
19 de outubro de 2017
