プロタミン（英: protamine）は、魚類の精巣から抽出されるタンパク質の主成分である。 食品添加物として用いられており、塩基性で水に溶け、耐熱性芽胞菌に対して増殖抑制効果を持つ。また、医療用に頻用される抗凝固薬ヘパリンの中和作用も持つ。このペプチドは、細胞膜の溶解またはを引き起こすことなく、その抗菌効果を発揮することが知られている。 1989年に製造特許が出願されている。供給メーカーは上野製薬と。
